アプタマーベースのプロテオミックプロファイリングは,心臓血管疾患における新たな候補バイオマーカーと経路を明らかにする
Debby Ngo1, Sumita Sinha1, Dongxiao Shen1
1From Division of Pulmonary and Critical Care Medicine, Department of Medicine (D.N.) and the Cardiovascular Research Center (D.N., S.S., D.S., M.J.K., X.S., M.D.B., J.F.O., L.A.F., R.E.G.), Massachusetts General Hospital, Harvard Medical School, Boston; Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA (E.W.K., H.K., S.A.C., R.E.G.); Cardiovascular Division, Brigham and Women's Hospital, Boston, MA (M.D.B., M.S.S.); Cardiology Division, Massachusetts General Hospital, Harvard Medical School, Boston (M.A.F., M.S.S., R.E.G.); Preventive Medicine Section, Department of Medicine, Boston University School of Medicine, MA (R.S.V.); Department of Biostatistics, Boston University School of Public Health, MA (M.G.L.); The National Heart, Lung, and Blood Institute's Framingham Heart Study, Framingham, MA (M.G.L.); Division of Cardiovascular Medicine, Vanderbilt University, Nashville, TN (T.J.W.); and Division of Cardiovascular Medicine, Beth Israel Deaconess Medical Center, Boston, MA (R.E.G.).
アプタマーベースのプロテオミクスプラットフォームは,心筋梗塞後の200以上のタンパク質変化を検知し,心筋梗塞のための新しいバイオマーカーを特定しました. この技術により,大規模なヒト群のプロテオミク分析が可能になります.
科学分野:
- プロテオミクス
- バイオマーカーの発見
- 心血管研究
背景:
- 単一鎖DNAアプタマーはタンパク質結合に高い特異性と親和性を有する.
- アプタマーベースの技術は,従来のプロテオミクスの方法の代替手段であり,サンプルスループットの低さなどの制限に対処します.
研究 の 目的:
- アプタマーベースのプロテオミックプラットフォームを使用して,心筋損傷の早期バイオマーカーを特定する.
- 心筋梗塞の臨床モデルと大規模なヒトコホートでのプラットフォームのパフォーマンスを評価する.
主な方法:
- 計画された心筋梗塞 (PMI) モデルに1129のタンパク質を測定するアプタマーベースのプロテオミックプラットフォームを適用しました.
- PMI前後 (10分と60分) の血液サンプルとタンパク質の変化を分析した.
- 独立したPMIコホートで検証された結果と,Framingham Risk Scoreのコンポーネントとの関連が評価されました.
主要な成果:
- PMI後の周辺血液で217の有意に変化したタンパク質が特定され,79は独立したコホートで検証された.
- Dickkopf関連のタンパク質4とcryptoを含む新しい心筋損傷バイオマーカーを発見した.
- フレイミングハムリスクスコアで156の有意なタンパク質関連が確認された.
結論:
- アプタマーベースのプロテオミクスツールは,高感度と精度で1000以上の低濃度アナリストをプロファイルできます.
- この技術は,詳細な干渉研究と大規模なヒトコホート分析の両方に適用できます.
- このプラットフォームは,心筋損傷と心血管リスクの評価のための新しいバイオマーカーの発見を促進します.
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