人間のSRMAtlas:完全なヒトプロテオームを定量化するための標的検査のリソース

科学分野:

• プロテオミクス
• 生物化学
• システム生物学

背景:

• ヒトのプロテオームを理解することは 細胞の機能や病気のメカニズムの解読に不可欠です
• タンパク質の定量化のための既存の方法は,しばしば範囲,特異性,またはアクセシビリティによって制限されています.

研究 の 目的:

• ほぼすべてのヒトのタンパク質を定量化するための包括的なリソースを開発する.
• 多様な生物学的サンプルで 信頼性の高い再現可能なタンパク質測定を可能にします

主な方法:

• 高度な特異性試験の要約を作成し,検証する.
• タンパク質の定量化のために,標的型質量スペクトロメトリー,特に選択された反応モニタリング (SRM) を利用した.
• ヒトのSRMAtlasを開発し,ペプチドの特定のための決定的な座標を提供しました.

主要な成果:

• アノテーションされた20277のヒトタンパク質の99.7%を定量化した.
• データには166,174のタンパク質型ペプチドが含まれ,タンパク質ごとに複数の測定法を提供しています.
• アッセイは,スプライスされた変種,変異,および翻訳後の修正を識別することができます.
• コレステロール合成の阻害とドセタキセル治療に対する細胞反応の研究に有用性が実証された.

結論:

• 人間のSRMAtlasは,プロテオミクスの研究のための貴重な,自由にアクセス可能なリソースです.
• システム生物学と疾患の研究を進めて タンパク質の総合的な定量化を可能にします
• 細胞ネットワークと治療反応の理解を深める