転写因子 の DNA 結合 変異 の 遺伝子
Bart Deplancke1, Daniel Alpern1, Vincent Gardeux1
1Laboratory of Systems Biology and Genetics, Institute of Bioengineering, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne and Swiss Institute of Bioinformatics, 1015 Lausanne, Switzerland.
Cell
|July 30, 2016
まとめ
非コーディングDNAの遺伝子変異は,転写因子 (TF) -DNA結合を変化させることで特性を影響する. しかし,ほとんどの結合変異は単純なモチーフの変化を超えたメカニズムから生じ,人間の特徴の複雑な遺伝的基盤を明らかにします.
科学分野:
- ゲノミクスと分子生物学
- エピジェネティクスと遺伝子調節
背景:
- 複合的な特質関連遺伝子変異は,非コーディングの規制領域に頻繁に存在する.
- これらの変異は,転写因子 (TF) -DNA結合モチーフを破壊し,遺伝子発現に影響することが知られている.
- 変数のTF-DNA相互作用は,フェノタイプの変化の重要な要因としてますます認識されています.
研究 の 目的:
- TF-DNA結合変異の理解におけるパラダイムシフトを要約する.
- 遺伝子変異によるTF-DNA結合の変動性に関する提案されたメカニズムをレビューする.
- 複雑な特徴と疾患の感受性における非コーディング変異の解剖への影響について議論する.
主な方法:
- 最近のTF-DNA結合イベントに関する全ゲノム研究のレビュー.
- TF-DNA結合変異の基礎となるメカニズムに関する発見の統合.
- コード化しない変種分析に対する生物学的影響に関する議論.
主要な成果:
- 変数のTF-DNA結合イベントのほとんどは,TF結合モチーフ内の直接的な配列変化によって引き起こされません.
- これは,TF-DNA結合の変異を誘発するより複雑な分子メカニズムを示している.
- 局所的,近接的,または遠隔の遺伝的変異は,TF-DNA結合に影響を与える可能性があります.
結論:
- TF-DNA結合の多様性を理解することは,個体間のフェノタイプ的多様性を説明するために極めて重要です.
- これらのメカニズムの複雑さは,非コーディングの変数を解剖する伝統的なアプローチに挑戦しています.
- これらのメカニズムと 複雑な特徴や病気における その役割を解明するには さらに研究が必要です
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