フォスフォプロテオーム統合は前立腺がんにおける患者特有のネットワークを明らかにする
Justin M Drake1, Evan O Paull2, Nicholas A Graham3
1Department of Microbiology, Immunology, and Molecular Genetics, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA 90095, USA; Rutgers Cancer Institute of New Jersey and Department of Medicine, Rutgers-Robert Wood Johnson Medical School, New Brunswick, NJ 08903, USA.
Cell
|August 9, 2016
まとめ
この研究は,統合されたフォスフォプロテオミクスデータを用いて,転移性除抵抗性前立腺がん (CRPC) の個別化されたシグナル伝達経路を明らかにした. これらの発見は,進行した前立腺がんにおける患者層分化と標的治療の選択のための新しいアプローチを提供します.
科学分野:
- 腫瘍学
- 分子生物学
- バイオ情報学
背景:
- 転移性除抵抗性前立腺がん (CRPC) は複雑な信号ネットワークを持つ致死性疾患です.
- これらのネットワークを理解することは 効果的な標的治療の開発に不可欠です
研究 の 目的:
- CRPCにおける経路分析のためのマルチオームデータ (ゲノム,トランスクリプトミク,フォスフォプロテオミク) を統合する.
- CRPCにおけるパーソナライズされた信号経路のサインを特定するための方法を開発する.
- 個々のCRPC患者の薬剤優先順位を決めるための基準を提供すること.
主な方法:
- 致命的な転移性CRPC患者の迅速な解剖から得られた臨床組織を用いた.
- インタラクティブ・イベント (TieDIE) を通じて様々なデータセットを統合する.
- 強化されたシグナル伝達経路を特定するために,MSigDBの特徴的な遺伝子セットとフォスフォプロテオミックデータを適用した.
主要な成果:
- CRPCで薬効性キナーゼ経路の強力なシグナルネットワークを合成した.
- 6つの主要な信号経路が CRPC 腫瘍で著しく強化されました
- 統合されたパーソナライズドシグネチャー (pCHIPS) を使用して,発酵ベースの癌の特徴を開発した.
結論:
- pCHIPSは,転移したCRPCの活性化信号経路の多様性を効果的に明らかにしました.
- 開発された経路ベースの参照は,個々の患者の薬物優先順位を決めるのに役立ちます.
- このアプローチは,前立腺がんの末期段階における患者層分化と標的治療の可能性を秘めています.
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