60,706人のヒトにおけるタンパク質をコードする遺伝的変異の分析
Monkol Lek1,2,3,4, Konrad J Karczewski1,2, Eric V Minikel1,2,5
1Analytic and Translational Genetics Unit, Massachusetts General Hospital, Boston, Massachusetts 02114, USA.
60,706人の多様な個体からのヒトの遺伝子変異の大きなデータセットは,DNA変化の解釈のためのカタログを提供します. このリソースは,病気を引き起こす変種を特定し,ヒトの遺伝子ノックアウトを発見するのに役立ちます.
科学分野:
- ゲノミクス
- 人間 の 遺伝子
- バイオ情報学
背景:
- DNA配列の変化を解釈するには,ヒトの遺伝子変異に関する包括的なデータが必要です.
- 過去のデータセットは 規模と多様性がなく 信頼性の高い分析が可能でした
研究 の 目的:
- 大規模で多様なコホートから高品質のエクソームDNA配列データを集めて分析する.
- 変種解釈と遺伝子機能の研究のためのヒトの遺伝的多様性の参照カタログを作成する.
主な方法:
- 60,706人のエクソームシーケンシングデータを収集して分析した.
- 変種病原性を計算し,選択中の遺伝子を特定するための方法を開発した.
- ヒトの遺伝的多様性と変異再発パターンを分類した.
主要な成果:
- ヒトの遺伝子変異のカタログを 作成した. 平均して8基に1つの変異がある.
- 3,230の遺伝子で 予測されたタンパク質の断片化変種が ほぼ完全になっていました
- 候補病変のフィルタリングとヒトのノックアウト変異の発見に有用性が実証されています.
結論:
- エクソーム・アグレゲーション・コンソーシアム (ExAC) のデータセットは,ヒト遺伝学の研究にとって貴重なリソースです.
- カタログは客観的な病原性指標と機能的に重要な遺伝子の識別を容易にする.
- このデータは効率的な変異フィルタリングとヒトの遺伝子ノックアウトの発見を可能にします
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