子供における下痢の原因を特定するための定量分子診断法の使用:GEMS症例対照研究の再分析

科学分野:

• 世界保健
• 感染症
• 分子診断

背景:

• 腹は世界の子供の死亡の主な原因です
• 正確な診断は,さまざまな方法とテストの可変性によって困難です.
• グローバル・エンテリック・マルチセンター研究 (Global Enteric Multicenter Study, GEMS) は当初,様々な微生物学的手法を使用した.

研究 の 目的:

• 定量分子診断を用いて下痢の原因を再評価する.
• 新しい発見とオリジナルのGEMS診断方法を比較する.
• 病原体特有の病原体発生率と病重を決定する.

主な方法:

• 定量的なリアルタイムPCR (qPCR) を使用し,便のサンプルで32の腸病原体を検出した.
• GEMSコホートにおける症例と対照群の5304のペア化されたサンプルを分析した.
• 元のGEMS方法 (培養,EIA,RT-PCR) と qPCR結果を比較した.

主要な成果:

• qPCRは,元の方法と比較して,ほとんどの病原体に対してより高い発生率を特定しました.
• シゲラ種,ロタウイルス,アデノウイルス40/41,ST-ETEC,Cryptosporidium種,Campylobacter種 病原菌のトップ6位でした.
• qPCRにより,集団レベルによる下痢の負担は51. 5%から89. 3%に増加した.
• 症例の42. 5%には1つの病原体があり,38. 9%には2つ以上の病原体があり,シゲラとロタウイルスは混合感染で顕著でした.

結論:

• 定量的な分子診断は下痢の原因の特徴を高める.
• 大量の下痢は 6つの特定の病原体と関連しています
• これらの病原体に対する 標的を絞った介入を優先することは 幼児死亡率を減らすために 極めて重要です