機能的代謝は酵母生物合成レギュロームを記述する
Michael Mülleder1, Enrica Calvani1, Mohammad Tauqeer Alam2
1Department of Biochemistry and Cambridge Systems Biology Centre, University of Cambridge, Cambridge CB2 1GA, UK; The Francis Crick Institute, Mill Hill Laboratory, Mill Hill, London NW7 1AA, UK.
Cell
|October 4, 2016
まとめ
この研究は酵母遺伝子の代謝相互作用をマッピングし,遺伝子の3分の1以上が生物合成に影響を及ぼすことを明らかにしました. メタボロミックシグネチャーは,特徴づけられていない遺伝子の機能を特定し,細胞の調節を理解するのに役立ちます.
科学分野:
- 分子生物学
- システム生物学
- メタボロミクス
背景:
- ゲノムと代謝の相互作用は 細胞の成長と機能に不可欠です
- これらの相互作用を理解することは 細胞の制御ネットワークを解読する鍵です
- 系統的な遺伝子削除研究は 機能的ゲノミクスの強力なツールです
研究 の 目的:
- サッカロマイセスのアミノ酸代謝と遺伝子削除への反応を定量化する.
- 生物合成代謝に対する遺伝子の機能的貢献を定義する.
- 特徴化されていない遺伝子の機能的アノテーションのためにメタボロミックデータを活用する.
主な方法:
- サッカロマイセスのアミノ酸代謝体の定量化
- 代謝反応を観察するための系統的な遺伝子消去分析.
- メタボリックレギュレータと効果因子を結びつける機能的メタボロミクス
主要な成果:
- 配列遺伝子の3分の1以上,特にクロマチンの動力学,翻訳,輸送に関与する遺伝子は,生物合成代謝に寄与する.
- 異なるアミノ酸の代謝シグネチャーは遺伝子機能と相関する.
- メタボロミックシグネチャーは 特徴づけられていない酵母遺伝子の半分以上に対して 機能的なアノテーションを提供し 遺伝的および物理的な相互作用ネットワークを超えた洞察を提供します
結論:
- 遺伝子をコードする遺伝子の重要な部分は 遺伝子代謝の相互作用に参加し 規制ネットワークを明らかにします
- メタボロミックプロファイリングは遺伝子機能と細胞の調節を探求するための新しいアプローチを提供します.
- この研究は,未知の代謝空間を探索することによって,遺伝子機能の理解を広げています.
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