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From DNA to Protein03:06

From DNA to Protein

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The flow of genetic information in cells from DNA to mRNA to protein is described by the central dogma, which states that genes specify the sequence of mRNAs, which in turn specify the sequence of amino acids making up all proteins. The decoding of one molecule to another is performed by specific proteins and RNAs. Because the information stored in DNA is so central to cellular function, it makes intuitive sense that the cell would make mRNA copies of this information for protein synthesis...
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The Central Dogma01:25

The Central Dogma

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Overview
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The Central Dogma01:20

The Central Dogma

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The central dogma explains the flow of genetic information from DNA nucleotides to the amino acid sequence of proteins.
RNA is the Missing Link Between DNA and Proteins
In the early 1900s, scientists discovered that DNA stores all the information needed for cellular functions and that proteins perform most of these functions. However, the mechanisms of converting genetic information into functional proteins remained unknown for many years. Initially, it was believed that a single gene is...
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Leaky Scanning02:28

Leaky Scanning

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During most eukaryotic translation processes, the small 40S ribosome subunit scans an mRNA from its 5' end until it encounters the first start AUG codon. The large 60S ribosomal subunit then joins the smaller one to initiate protein synthesis. The location of the translation initiation is largely determined by the nucleotides near the start codon as there may be multiple translation initiation sites present on the mRNA.  Marilyn Kozak discovered that the sequence RCCAUGG (where R...
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Exon Recombination02:32

Exon Recombination

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The evolution of new genes is critical for speciation. Exon recombination, also known as exon shuffling or domain shuffling, is an important means of new gene formation. It is observed across vertebrates, invertebrates, and in some plants such as potatoes and sunflowers. During exon recombination, exons from the same or different genes recombine and produce new exon-intron combinations, which might evolve into new genes. 
Exon shuffling follows “splice frame rules.” Each exon...
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Gene Conversion02:08

Gene Conversion

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Other than maintaining genome stability via DNA repair, homologous recombination plays an important role in diversifying the genome. In fact, the recombination of sequences forms the molecular basis of genomic evolution. Random and non-random permutations of genomic sequences create a library of new amalgamated sequences. These newly formed genomes can determine the fitness and survival of cells. In bacteria, homologous and non-homologous types of recombination lead to the evolution of new...
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  2. ゲノム再コーディングによる同義的なコドン圧縮スキームの定義
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ゲノム再コーディングによる同義的なコドン圧縮スキームの定義

Kaihang Wang1, Julius Fredens1, Simon F Brunner1

  • 1Medical Research Council Laboratory of Molecular Biology, Francis Crick Avenue, Cambridge, UK.

Nature
|November 4, 2016

PubMed で要約を見る

まとめ
この要約は機械生成です。

科学者は細菌のゲノムを書き換える新しい方法を開発し,合成DNAの作成を可能にしました. この画期的な発見により エシェリキア・コライの 系統的なゲノム再コーディングが可能になり 遺伝子設計のルールを定めたのです

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科学分野:

  • 合成生物学
  • ゲノミクス
  • 分子生物学

背景:

  • ゲノムの合成再コーディングは,正交変換システムを用いて非自然なポリマーの合成を可能にすることを目的としています.
  • 同義的なコドン置換の理解が限られており,段階的なゲノム置換の方法が欠如しているため,進歩が妨げられます.

研究 の 目的:

  • エシェリキア・コライの長い合成DNAでゲノムDNAを効率的かつプログラム可能な形で置き換えるシステムを開発する.
  • 合成ゲノムで許容される設計機能と許容されない設計機能に関するフィードバックを確立する.

主な方法:

  • CRISPR/Cas9を用いて,エピソーマレプリカンの二重鎖DNAを in vivo で切除した.
  • 段階的なゲノム置換のための同時陽性・陰性選択によるラムダ赤媒介再結合を用いる.
  • 系統的なゲノム再コーディングのための重要なオペロンに8つの同名の再コーディングスキームを適用しました.

主要な成果:

  • ゲノムDNAを長 (> 100kb) の合成DNAで効率的かつプログラム可能な形で置き換えるシステムを実証した.
  • エシェリキア・コライにおける段階的な全ゲノム置換の基礎を確立した.
  • 同義的な再コーディングスキームを許容し,許容しないことと,特定された特異的な再コーディングポジション.

結論:

  • 開発されたシステムは,効率的でプログラム可能な合成ゲノム工学を容易にする.
  • この研究は,同義的なコドン使用とゲノム設計のルールに関する重要な洞察を提供します.
  • 将来の合成ゲノムアプリケーションのための再コーディングエラーの識別と修復を可能にします.