合成染色体と混同染色体の3D組織

Guillaume Mercy^1,2,3, Julien Mozziconacci⁴, Vittore F Scolari^1,2

¹Spatial Regulation of Genomes, Department of Genomes and Genetics, Institut Pasteur, Paris 75015, France.

Science (New York, N.Y.)

|March 11, 2017

まとめ

合成酵母ゲノム Sc2.0は設計上の変更にもかかわらず全体的なゲノム組織を維持しています Hi-C分析により,より滑らかな染色体構成が明らかになり,synIIIとsynXIIのような特定の例外が特定されます.

科学分野:

合成生物学
ゲノミクス
クロマチン形状

背景:

Sc2.0プロジェクトは合成酵母ゲノムを作成することを目的としています.
設計者の変更と繰り返し削除はゲノム組織と細胞機能に影響を与える可能性があります

研究の目的:

Hi-Cを用いてSc2.0染色体の3D構造を決定する.
合成ゲノム設計が大規模なゲノム組織に与える影響を評価する.

主な方法:

Hi-C (ハイ・スループット・クロモソーム・コンフォーム・キャプチャー) 技術は採用された.
3次元 (3D) ゲノム構造を推論するための接触パターンの分析.

主要な成果:

合成酵母染色体は繰り返し欠落するのでより滑らかな接触パターンを表します
世界的なゲノム組織は合成染色体によってほとんど影響を受けていません
synIII (交配型カセットがない) と synXII (リボソームDNAが移転した) は例外です.
接触マップはSCRaMbLE株の再配置を検出するために使用されました.

結論:

Sc2.0の合成ゲノム設計は,全体的な3Dゲノムアーキテクチャを保存しています.
特定のゲノム領域は変異した形状を示し特定の場所の感受性を強調します
Hi-Cは合成ゲノム構造と再編成を特徴付けるための貴重なツールです.

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