化学合成X染色体のバグマッピングとフィットネステスト
Yi Wu1,2, Bing-Zhi Li1,2, Meng Zhao1,2
1Key Laboratory of Systems Bioengineering (Ministry of Education), School of Chemical Engineering and Technology, Tianjin University, Tianjin, 300072, PR China.
Science (New York, N.Y.)
|March 11, 2017
まとめ
合成ゲノムデバッグは デザイナーのゲノムを作るのに不可欠です 合成酵母X染色体 (synX) の遺伝的変異を効率的に特定し修正し,その機能を改善する新しいプールPCRTagマッピング (PoPM) メソッドです.
科学分野:
- 合成生物学
- ゲノミクス
- 分子生物学
背景:
- 設計された真核ゲノムを作るには 合成DNA配列のデバッグが必要です
- 707,459塩基対の合成染色体である酵母合成染色体X (synX) が化学合成された.
- SynXは様々な状況で 堅実なフィットネスを示した.
研究 の 目的:
- 合成ゲノムにおける遺伝的変異を特定し修正するための効率的な戦略を開発する.
- 合成染色体デバッグのためのプールPCRTagマッピング (PoPM) の有用性を検証する.
主な方法:
- 酵母合成染色体X (synX) の化学合成
- 遺伝子変異を特定するためのPCRTagマッピング (PoPM) の開発と適用
- 複合的な増幅,再コードされた配列,およびプロモーターに関連する変異を含む,特定された遺伝的バグの修正.
主要な成果:
- SynXは成功して合成され,良好な体調を示した.
- PoPMは細胞の健康に影響を与える遺伝的変異を効果的に特定しました.
- 修正されたバグには,複雑な増幅,FIP1の成長欠陥,ATP2プロモーター機能に影響するロックスシン部位が含まれています.
結論:
- PoPMは合成酵母ゲノムをデバッグするための強力で一般化可能なツールです
- 開発された戦略は,合成生物学における効率的なフェノタイプ-ゲノタイプマッピングを可能にします.
- この研究は 設計性ユーカリオットゲノムの構築を進めています
