合成染色体統合の合成,デバッグ,および効果: synVIとそれ以上のもの

科学分野:

• 合成生物学
• ゲノミクス
• 分子生物学 と 細胞生物学

背景:

• Sc2.0プロジェクトは合成酵母ゲノムを構築することを目的としています.
• 大規模なゲノム変異の影響を 理解することは極めて重要です

研究 の 目的:

• 合成酵母染色体VI (synVI) を設計,組み立て,特徴づけること.
• 合成染色体を単一株に統合した結果について調べる
• 遺伝的"バグ"とその現象的効果を特定する.

主な方法:

• synVIの迅速な組み立てと特徴付け
• タンパク質蓄積の欠陥を特定するためのプロテオミック分析
• 多合成菌株のフェノタイプ,転写,およびタンパク質全体の分析.

主要な成果:

• synVIのミトコンドリア欠陥は,PRE4の同義的なコーディング変化と関連しており,PRE4タンパク質を半減させた.
• 16の合成染色体をポリ合成株に統合すると,HIS2の転写に関連する"バグ"が明らかになった.
• 広範なゲノム変異 (6%のゲノム) は,オミクス分析において大きな世界的な変化を引き起こさなかった.

結論:

• 合成染色体VIの組み立てと特徴付けは成功している.
• 合成染色体の統合は特定の欠陥を導入しますが,広範なオミックスの障害を引き起こすことはありません.
• この研究は,設計された合成エウカリオットゲノムの作成を進めている.