Ssb-Nascent Chain Interactionsのプロファイリングは,Hsp70アシストされた折り畳みの原理を明らかにする
Kristina Döring1, Nabeel Ahmed2, Trine Riemer1
1Center for Molecular Biology of Heidelberg University (ZMBH), DKFZ-ZMBH Alliance, Im Neuenheimer Feld 282, Heidelberg, Germany; German Cancer Research Center (DKFZ), Im Neuenheimer Feld 280, Heidelberg, Germany.
Cell
|July 15, 2017
まとめ
イーストのHsp70チャペロンSsbは新生タンパク質に結合し,折り畳みと標的を特定するのに役立ちます. タンパク質の折り畳みを調整し 変換を加速するために ダイナミックな相互作用を利用します
科学分野:
- 分子生物学
- 細胞生物学
- 生物化学
背景:
- イーストのHsp70チャペロンSsbは,リボソームと新生ポリペプチドと相互作用することで,タンパク質の折りたたみにおいて重要な役割を果たします.
- その正確なメカニズムを理解することは,共翻訳タンパク質の処理を理解するための鍵です.
研究 の 目的:
- Ssb の動作原理を,その新生連鎖結合パターンをほぼ残留解像度で決定することによって解明する.
- タンパク質の折り畳み,トランスレーションダイナミクス,および臓器タンパク質標的化におけるSsbの役割を調査する.
主な方法:
- 新生ポリペプチドとのSsb相互作用をマッピングするために,in vivo選択的なリボソームプロファイリングを使用した.
- リボソームの足跡密度をオープン・リーディングフレーム (ORF) で分析し,変換速度を評価する.
主要な成果:
- Ssbは,一般的なシャパロン機能を示す,細胞,核,ミトコンドリア,ER新生タンパク質と広く関連しています.
- Ssbは,充電されたアロマティックアミノ酸に富んだモチーフで,複数の結合-放出サイクルを通じて基板を巻き込む.
- リボソーム関連複合体 (RAC) は Ssb アソシエーションに必要ですが,新生ポリペプチド関連複合体 (NAC) はそうではありません.
- Ssbの結合は,mRNA構造,コドン使用,およびSsbの作用によって影響されるより速い翻訳と相関する.
結論:
- Ssbは,共同翻訳タンパク質の折り畳みを管理するために,ダイナミックで基板に合わせた相互作用を使用します.
- Ssbは加速翻訳を促進し,臓器タンパク質の膜標的化をサポートします.
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