地面状態とプロモーター・リージョンの方向性

科学分野:

• 遺伝学
• 分子生物学
• 進化生物学

背景:

• ユカリオットのプロモーター領域は,多くの場合,体内での異なった転写を示します.
• 異なる転写によって生成される反意味RNAの生物学的意義は不明である.
• 異なった転写がRNAポリメラーゼII (Pol II) の転写の機能的結果かメカニズム的副産物かは不明である.

研究 の 目的:

• ユカリオットプロモーター領域からの異なった転写の機能的意義を調査する.
• アンチセンセスのRNAは機械的な副産物なのか,それとも生物学的な意味があるのかを判断する.
• プロモーターの方向性の進化的形成を探求する.

主な方法:

• 新生トランスクリプトマッピングを用いた 機能的進化論的アプローチ
• 異種酵母DNAを含むS. cerevisiae菌株の分析
• ネイティブ対外国DNA環境と新たに進化したヒトの強化剤/促進剤における転写方向性の比較.

主要な成果:

• プロモーター領域は,外来DNA環境に置かれたとき,ネイティブの方向性を失います.
• 異なったDNAの偶然のプロモーター領域は,等しく双方向の転写を示し,メカニズム的基盤を示唆する.
• 最近進化したヒト強化剤とプロモーター領域は,双方向性を増している.
• 進化過程は新しい機能のための双方向のプロモーターを 浄化したり保持したりします

結論:

• ユカリオットのプロモーター領域は本質的に双方向です.
• 異なった転写は,転写開始のメカニズム的な特徴です.
• 進化の圧力により,プロモーター領域は,コード化RNAへの転写を偏向させる.
• この固有の双方向性の副産物としてアンチセンセスのRNAが生じる可能性があります.