機能的ゲノミクスのための可逆ハプロイドマウス胚性幹細胞バイオバンク

科学分野:

• 遺伝学
• 幹細胞生物学
• 分子生物学

背景:

• 機能的ゲノミクスの研究は不可欠ですが,しばしば細胞集団のクローン変異によって妨げられます.
• 生物学的研究における再現性は,固有の細胞異質性のために重要な課題である.

研究 の 目的:

• ゲノムの機能的な注釈のための包括的なリソースを確立する.
• 高通量遺伝子スクリーンのクローン変異を克服する方法を開発する.
• 重要な細胞プロセス,血管新生,ウイルス感染症に関与する新しい遺伝子を特定する.

主な方法:

• ゲノム飽和型変異は,100,000以上のハプロイドマウス胚幹細胞 (mES) のバイオバンクを生成するために使用されました.
• それぞれの細胞系には 16,970個の遺伝子を標的とした 遺伝的にバーコード化された 条件付きの 逆転可能な変異があります
• 逆転性突然変異は,姉妹細胞の直接的な機能的アノテーションを可能にするために利用され,クローンバリエーションを軽減しました.

主要な成果:

• ヘミ/ホモジゴス変異mES細胞の資源であるハプロバンクが作成され,研究者に提供されました.
• ハプロバンクを用いた逆遺伝子スクリーンは,mES細胞における重要なプロセスを調節する遺伝子,芽生えた血管新生,および血管系統の特異性を特定した.
• ゲノム全体の前方スクリーンは,PLA2G16を,ライノウイルス誘発の細胞毒性にとって重要な宿主因子として特定した.

結論:

• ハプロバンクとリバーシブル変異技術が組み合わせて,高通量で再現可能な機能的なゲノムアノテーションのための強力なプラットフォームを提供します.
• このリソースは,遺伝子機能とその様々な生物学的現象への貢献を明らかにする能力を大幅に向上させます.
• この研究は,基本的な生物学的プロセスや病気のメカニズムに関与する遺伝子の発見におけるハプロバンクの有用性を強調しています.