計画された心筋梗塞に対する大規模なアプタマーベースのプロテオミックプロファイリングの適用
Jaison Jacob1, Debby Ngo2,3, Nancy Finkel1
1Novartis Institute for BioMedical Research, Chemical Biology and Therapeutics, Cambridge, MA (J.J., N.F., R.P., S.G., T.M., L.L.J.).
Circulation
|December 10, 2017
まとめ
この研究では,新しい心筋損傷バイオマーカーを特定するために,アプタマープロテオミックプロファイリングを拡張しました. このスケーラブルなプラットフォームは,心臓損傷の早期指標を含む247の検証されたタンパク質を特定しました.
科学分野:
- プロテオミクス
- バイオマーカーの発見
- 心血管研究
背景:
- 新しい親和性ベースのプロテオミクス技術は,効率的なマルチプレキシングと高サンプルスループットを可能にします.
- アプタマーベースのプロテオミックプロファイリングは,以前,心筋損傷バイオマーカーの1129のタンパク質を特定するために使用されました.
- この研究は,心筋損傷の研究のためのより広い範囲のヒトタンパク質にプラットフォームを拡張します.
研究 の 目的:
- 心筋損傷に対するアプタマーベースのプロテオミックプロファイルのスケーラビリティを検証する.
- 拡張されたプラットフォームを使用して,心筋損傷に関連する新しいタンパク質バイオマーカーを特定する.
主な方法:
- 4783個のヒトタンパク質を 拡張アプタマープロテオミック技術で測定した.
- 計画された心筋損傷,自発性心筋梗塞,およびコントロールの誘導および検証コホートを使用した.
主要な成果:
- 特定された376のタンパク質は,誘導コホートにおける計画的な心筋損傷後に有意に変化した.
- 独立したコホートで247のタンパク質を検証し,方向性一致度は>90%でした.
- 負傷後1時間以内に上昇したタンパク質は,自発性心筋梗塞の患者でも上昇した.
- 心臓のメカニカル伝達とストレス反応に作用する新しい循環タンパク質を特定した.
結論:
- 大規模なアプタマーマルチプレキシングの実現可能性が証明された.
- 拡張されたプラットフォームは,心筋損傷におけるバイオマーカーと経路の発見にユニークな機会を提供します.
