人の細胞の遺伝子景観を描写する

Max A Horlbeck¹, Albert Xu¹, Min Wang²

¹Department of Cellular and Molecular Pharmacology, University of California, San Francisco, San Francisco, CA 94158, USA; Howard Hughes Medical Institute, University of California, San Francisco, San Francisco, CA 94158, USA; California Institute for Quantitative Biomedical Research, University of California, San Francisco, San Francisco, CA 94158, USA.

Cell

|July 24, 2018

まとめ

この研究では,CRISPRの干渉を用いてヒトの遺伝子相互作用 (GI) をマッピングし,遺伝子機能と予期せぬ経路のリンクを明らかにしました. 細胞遺伝学を理解するための強力なツールとして GIマップを確立しました

科学分野:

遺伝学
分子生物学
システム生物学

背景:

酵母で示されているように遺伝子の相互作用 (GI) は遺伝子の機能を理解するために不可欠です
以前のヒト細胞研究では,限られた遺伝子セットが使用され,大規模なGIマッピングの実現可能性は未解決のままでした.

研究の目的:

ヒトのGIの量的なマッピングのためのCRISPRの干渉プラットフォームを開発し,実装する.
機能的なゲノミクスと経路の発見のための包括的なヒトの GI マップを作成します.

主な方法:

CRISPRの干渉プラットフォームを用いた2つの癌細胞系における222,784の遺伝子ペアの系統的な干渉.
機能的な遺伝子ネットワークを構築するための遺伝子相互作用データの定量分析.

主要な成果:

機能的に関連した遺伝子を成功裏に集める大規模なヒトGIマップを作成した.
TMEM261を電子輸送連鎖の構成要素として識別するなど,悪質に特徴づけられた遺伝子に割り当てられた機能.
コレステロールの生合成とATR/9-1-1経路によるDNA損傷反応との関連を含む新しい経路の関係を発見した.

結論:

ヒトのGIマップは高解像度で遺伝子の機能を解剖し複雑な生物学的関係を明らかにするツールです
開発されたプラットフォームと生成されたマップは,将来のヒト細胞での大規模な遺伝子景観の研究の青写真として機能します.

キーワード:

CRISPRについて CRISPRiについてエピスタシス機能的ゲノミクス遺伝子相互作用

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