非正規の開いた読書フレームの翻訳は,粘膜免疫を制御します
Ruaidhrí Jackson1, Lina Kroehling1, Alexandra Khitun2
1Department of Immunobiology, Yale University School of Medicine, New Haven, CT, USA.
Nature
|December 14, 2018
まとめ
科学者は以前は タンパク質をコードしないと考えられていた 多くのRNA分子が 実際には 機能的なタンパク質を生成することを発見しました これらの新しいタンパク質は,細菌感染やその他の病気の際に免疫反応に不可欠です.
科学分野:
- ゲノミクス
- 免疫学
- 分子生物学
背景:
- 哺乳類のタンパク質をコードするゲノムの現在の注釈は不完全です.
- タンパク質をコードする遺伝子を特定するための伝統的な方法は,新しい機能トランスクリプトを除外する特定の基準 (例えば,ORFサイズ,ATG開始) に基づいています.
- 非正規のオープン・リーディングフレーム (ORF) が機能性タンパク質をコードする可能性があることは,現在進行中の研究と議論の分野である.
研究 の 目的:
- タンパク質をコードする可能性について,以前は非コードとして注釈されていたRNAを調査する.
- 非正規のORFから生じる新しい機能性タンパク質を特定する.
- 免疫反応におけるこれらの新たに特定されたタンパク質の役割を決定する.
主な方法:
- バクテリア感染に反応するマクロファージでは,偏りのないトランスクリプトミックのアプローチが採用された.
- 非正規のORFを含む活性翻訳RNAを識別するためにリボソームプロファイリングを使用した.
- 非正規のORFから翻訳されたタンパク質の役割を in vivoで評価するために,機能的研究が行われました.
主要な成果:
- 非タンパク質コードとして注釈された有意な数のRNAは,リボソームと関連し,活性翻訳を示していることが判明しました.
- 安定した独特のタンパク質を生成できる,短い非ATG誘発ORFが特定されました.
- 長い非コーディングRNA Aw112010内の新しいORFは,細菌感染および大腸炎の際に粘膜免疫をオーケストラするのに不可欠であることが判明しました.
結論:
- 哺乳類のゲノムのタンパク質コーディングの可能性は,以前に理解されたものよりも広く,非正規のORFを含む.
- 非正規のORFから翻訳されたタンパク質は,免疫応答において重要な役割を果たします.
- 非コーディングRNAの誤った記述は,免疫および疾患における未発見のタンパク質コーディング遺伝子の機能を覆す可能性があります.
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