ヒストン脱メチラーゼKDM6Aは,クロマチンと細胞運命を制御するために直接酸素を感知する
Abhishek A Chakraborty1, Tuomas Laukka2, Matti Myllykoski2
1Department of Medical Oncology, Dana-Farber Cancer Institute and Brigham and Women's Hospital, Harvard Medical School, Boston, MA 02215, USA.
HIFや2- HGとは無関係な酸素感受性酵素によるヒストンのメチル化に直接影響する. KDM6Aによるこの酸素感知メカニズムは 細胞の分化とクロマチンの状態を調節します
科学分野:
- 細胞生物学
- エピジェネティクス
- 生物化学
背景:
- 酸素感知はメタゾアの生命に不可欠で 人間の病気にも関係しています
- 哺乳類の細胞は,ヒストンの脱メチル化を含む様々な機能のために,酸素依存酵素,2-オキシグルタレート (OG) 依存ダイオキシゲナーゼ (2-OGDD) を利用する.
- 低酸素がヒストンのメチル化に影響する正確なメカニズム,特にHIFと2- HGの役割は,まだ完全に理解されていません.
研究 の 目的:
- ヒストンデメチラゼに直接影響するかどうかを調査する.
- 低酸素誘発ヒストンのメチル化が低酸素誘発因子 (HIF) または2ヒドロキシグルタレート (2-HG) に依存しているかどうかを判断する.
- 酸素感知と細胞分化における特定の2-OGDDの役割を解明する.
主な方法:
- ヒストンのメチル化パターンの分析
- KDM6A/UTXとKDM6Bの活性と酸素感度の評価
- 細胞の分化に対するKDM6A喪失の影響を調査する.
- 低毒性細胞におけるH3K27メチル化ホメオスタシスの回復のための実験操作.
主要な成果:
- HIFと2- HGとは独立してヒストンのメチル化を促進する.
- ヒストン脱メチラーゼKDM6A/UTXは,そのパラログであるKDM6Bとは異なり,酸素に敏感であることが確認された.
- KDM6Aの喪失は,H3K27の脱甲基化を阻害し,細胞の分化を阻害することで,低酸素を模倣した.
- 低酸素細胞の逆分化欠陥におけるH3K27メチル化ホメオスタシスの回復
結論:
- 細胞の運命を制御するために,酸素はクロマチンレギュレータ,特にKDM6Aを直接制御します.
- KDM6Aは直接的な酸素センサーとして作用し,酸素レベルと表遺伝的変化や分化などの細胞過程を結びつけます.
- これらの発見は,クロマチンを改変する酵素による直接の表遺伝子調節を含む新しい酸素感知経路を明らかにしています.
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