哺乳類のISWIとSWI/SNFは,異なる転写因子の結合を選択的に媒介する
Darko Barisic1,2,3, Michael B Stadler1,4, Mario Iurlaro1
1Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research, Basel, Switzerland.
哺乳類のISWI (SNF2H) 複合体は,核細胞間隔と核組織にとって極めて重要です. 転写因子は,ISWIまたはSWI/SNF (BRG1) のような特定の染色体リモデラーに依存し,適切なゲノム結合を行う.
科学分野:
- 分子生物学
- ゲノミクス
- エピジェネティクス
背景:
- クロマチンのリモデラーは 核細胞を変化させることで DNAのアクセシビリティを管理し ゲノム利用に影響を与えます
- これらの複合体は癌で頻繁に変化しますが,グローバルな核細胞組織におけるそれらの特定の役割は不明です.
- 哺乳類の4つのリモデラーファミリー (SWI/SNF,ISWI,CHD,INO80) は,異なる機能を持っています.
研究 の 目的:
- SNF2H (ISWI) の細胞機能を調べ,BRG1 (SWI/SNF) と対比する.
- これらのリモデラーが 全球的な核細胞組織を調整し 転写因子結合に 影響を及ぼす方法を理解する
主な方法:
- SNF2Hを欠いた 生存可能な胚性幹細胞の生成
- 染色体改造におけるSNF2HとBRG1機能の比較分析
- 転写因子結合のリモデラー活動に関する系統的分析.
主要な成果:
- SNF2Hの喪失は核分裂を阻害し,リンカーDNAの長さを増加させ,核分裂間隔におけるISWIの役割を確認する.
- 特定の転写因子は,結合のためにSNF2HまたはBRG1に差異的な依存性を示す.
- CTCF結合にはSNF2Hが必要で,REST結合にはBRG1が必要である.
- SNF2Hは,染色体折り畳みとトポロジカルに関連したドメインの隔離に不可欠です.
結論:
- 哺乳類のISWI複合体は,核細胞周期性および核組織を維持するために不可欠です.
- 転写因子は,ゲノム結合特異性のために異なる染色体改造経路を使用します.
- この研究は,ISWIとSWI/SNFのゲノム構造と調節における特定の役割を明らかにしている.
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