マウスガストルレーションのマルチオミックプロファイリング 単細胞解像度
Ricard Argelaguet1, Stephen J Clark2, Hisham Mohammed3
1European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), Cambridge, UK.
Nature
|December 13, 2019
まとめ
初期のマウス胚の発達には 主要な表遺伝的変化が伴う. この研究は単細胞のマルチオミクスをマッピングし,細胞運命を決める前にメソデルマとエンドデルマの配列再構成を明らかにした.
科学分野:
- 発達生物学
- エピジェネティクス
- ゲノミクス
背景:
- 消化によって脊椎動物の体格が形成される.
- エピジェネティック・リプログラミングは ガストルレーションに伴いますが,細胞の運命選択における役割は不明です.
- 初期開発中の分子層間の調整は明らかにする必要があります.
研究 の 目的:
- マウス gastrulation 中のクロマチンのアクセシビリティ,DNA メチル化,RNA発現の単細胞マルチオミクスマップを作成する.
- 早期の細胞運命を決定する エピゲノムの役割を調査する
- エピジェネティックの変化と生殖層の仕様との連携を理解する.
主な方法:
- 単細胞マルチオミックプロファイリング (クロマチンのアクセシビリティ,DNAメチル化,RNA発現)
- マウス胚の分析 ガストルテーションの初期
- マルチオミクスデータのコンピューティング統合
主要な成果:
- プラリポテンスの出口は 抑圧的な表遺伝的状況と 結びついています
- 血統に特有の表遺伝子パターンは 胃化の過程で現れる.
- メソダームとエンドダームの細胞は,運命のコミットメント前に,協調された表層遺伝的再編成 (TET媒介の脱メチル化,アクセシビリティの向上) を示します.
- 外皮細胞は早期にメチル化とアクセシビリティを確立しています.
結論:
- 調節要素は,生殖層の細胞運命を決定する前に,表遺伝的にプリムされるか,再構成される.
- これは,原始的な生殖層の階層的な出現のための分子枠組みを提供します.
- この研究は,早期の細胞運命を選択し,分子層の調整におけるエピゲノムの役割を明らかにしている.


