非正規の人間の開いた読書フレームの広範囲な機能翻訳
Jin Chen1,2, Andreas-David Brunner3, J Zachery Cogan1,2
1Department of Cellular and Molecular Pharmacology, University of California, San Francisco, CA 94158, USA.
まとめ
研究者達は 人間の細胞で 標準的な遺伝子以外で 暗号化された 何百もの重要なマイクロタンパク質を発見しました これらのマイクロタンパク質は,免疫システムのプレゼンテーションと既知のタンパク質との複合体を形成するなど,多様な役割を持っています.
科学分野:
- 分子生物学
- ゲノミクス
- 人間の生理学
背景:
- リボソームプロファイリングは,トランスレーションが正規のコーディングシーケンス (CDS) 以外で発生することを示しているが,これらはほとんど特徴づけられていない.
- これらの非法典的な翻訳の機能的意義と細胞の役割は,ほとんど不明のままです.
研究 の 目的:
- 非正規のコード配列 (CDS) とそのコード化されたマイクロタンパク質をヒト細胞で体系的に特定し,特徴づけること.
- 細胞の機能,局所,およびこれらの新たに特定されたマイクロタンパク質の相互作用を調査する.
主な方法:
- 非正規のCDSを特定するために,体系的なCRISPRベースのスクリーニング戦略を使用しました.
- 細胞局所化,タンパク質相互作用の研究,およびヒト白血球抗原 (HLA) システムによるプレゼンテーションの分析を含む機能的特徴づけを行った.
主要な成果:
- 細胞の成長に不可欠な数百の非正規のCDSを特定しました.
- これらのCDSの破壊は,特異なトランスクリプトミックとフェノタイプの変化をもたらした.
- これらのCDSによって暗号化された微タンパク質の特徴は,異なる局所化,結合パートナー,およびHLAプレゼンテーションを明らかにします.
- アップストリーム・オープン・リーディングフレーム (uORF) にコードされたマイクロタンパク質が発見され,カノニカルタンパク質と機能的なビシストロニックオペロンを形成する.
結論:
- 人間の細胞は,正規のCDSの外で暗号化された重要な数の機能性マイクロタンパク質を使用します.
- これらのマイクロタンパク質は タンパク質複合体の形成と免疫監視を含む 細胞機能において 重要かつ多様な役割を果たします
- 哺乳類における機能的なビシストロニックオペロンの特定は,遺伝子調節とタンパク質生産に関する理解を広げています.
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