血液と組織の微生物群分析は,がんの診断方法を示唆している

科学分野:

• 腫瘍学
• 微生物群の研究
• ゲノミクス

背景:

• 癌の発生と進行に 微生物が関わっていることを示唆している.
• 癌ゲノムアトラス (TCGA) は,がんに関連した微生物のコミュニティを調査するための貴重なリソースを提供します.
• 癌の微生物群を理解することで 新しい診断戦略の可能性が生まれます

研究 の 目的:

• TCGAデータを用いて,様々な癌の微生物のサインを体系的に特徴づける.
• 血液中の微生物核酸の癌検出の診断の可能性を評価する.
• 腫瘍学における微生物ベースの診断ツールの実現可能性を評価する.

主な方法:

• 33種類の治療前の癌のサンプル1万8,116件から得られた全ゲノムと全トランスクリプトームの配列解析.
• 腫瘍組織と患者の血液の両方で微生物の読み取りと特徴づけ
• データの正確性を確保するために厳格な浄化方法の適用
• 早期がんおよび細胞フリー腫瘍DNAプラットフォームにおける血液ベースの微生物シグネチャの検証
• 血由来微生物核酸を用いた健康な個人と癌患者の差別化

主要な成果:

• 組織と血液のサンプルで 独特の微生物のシグネチャが 大多数の主要な癌の内側と内側で特定されました
• 血液ベースの微生物シグネチャーは,早期がん (Ia-IIc) と検出可能なゲノム変異がないがんの予測値を示した.
• 広範な汚染除去 (92.3%までのデータ除去) の後でも,シグネチャーは予測的であり続けました.
• プラズマに由来する微生物核酸は,健康な個人と前立腺がん,肺がん,メラノーマの患者の区別を可能にしました.

結論:

• 癌の微生物群には 診断の可能性のある 独特の特徴があります
• 血液中の微生物核酸は 癌検出の有望で非侵襲的なバイオマーカーです
• マイクロバイオームベースの腫瘍診断に関するさらなる研究は,その臨床的有用性を調査するために正当化されています.