自閉症で拡張されたタンデムDNAの全ゲノム検出

科学分野:

• ゲノム学と遺伝学
• 神経発達障害
• 人間 の 遺伝子

背景:

• タンデムDNAの複製は 40以上の単一遺伝疾患の 既知の原因です
• 自閉症スペクトル障害 (ASD) のような複雑な遺伝的疾患におけるタンデム・リピート・エクスパンションの役割と異質性は,ほとんど未調査のままである.
• 複合的な疾患への貢献を理解するために,タンドムリピートの全ゲノム特性を調査することが重要です.

研究 の 目的:

• 自閉症スペクトル障害 (ASD) の個体と集団コントロールにおけるタンデムDNAの繰り返し (2-20塩基対モチーフ) の全ゲノム特性を調査する.
• 一般集団では珍しいが,ASDの個体ではより一般的である,遺伝子関連タンドムリピート拡張を特定する.
• これらの稀なタンデム・リピート・エクスペンションとASDにおけるIQや適応能力などの表型特性の関連性を探求する.

主な方法:

• 2〜20の塩基対のモチーフ長さのタンデム繰り返しの全ゲノム分析
• ASDの家族と集団のコントロールの17,231のゲノムにおけるタンデムリピート特徴の比較.
• 統計分析により,ASDの患者では,影響を受けていない兄弟に比べて,タンデム・リピート・エクスパンションが有意に多く見られる.

主要な成果:

• 広範なポリモルフィズムが,ゲノム全体で並行して繰り返されるモチーフのサイズと配列で観察されました.
• 2,588のロシは遺伝子に関連したタンデム・リピート・エクスパンションを示したが,これは対照群では稀だが,特に神経発達および心血管/筋肉関連遺伝子のコード化およびスプライス・ジャンクション領域では,ASDを有する個体において有意に多く見られる.
• 稀なタンデム再発はASDの子供の23. 3%と対照群の20. 7%で発見され,ASDリスクに推定2. 6%の影響を及ぼし,IQと適応能力の低下と関連していました.

結論:

• タンデムDNAの繰り返し拡張は,自閉症スペクトル障害 (ASD) の遺伝的病因において重要な要因である.
• これらの拡張はASDの現象的複雑性に寄与し,認知機能と適応機能の低下を伴う.
• この研究では,DMPKやFXNのような既知の疾患遺伝子と共に,FGF14やCACNB1のような遺伝子における新しいASD関連タンデムリピート拡大を特定した.