配列特異のグリコサミノグリカン結合タンパク質の識別のための光相関性プローブ
Amélie M Joffrin1, Linda C Hsieh-Wilson1
1Division of Chemistry and Chemical Engineering, California Institute of Technology, 1200 East California Boulevard, Pasadena, California 91125, United States.
Journal of the American Chemical Society
|August 14, 2020
まとめ
研究者は,生きている細胞におけるグリコサミノグリカン (GAG) - タンパク質の相互作用をマッピングするために,新しいフォトアフィニティプローブを開発した. このアプローチは神経の可塑性や病気に関与する 50以上の新しいタンパク質を特定し GAGの機能に関する理解を深めました
科学分野:
- 生物化学
- 細胞生物学
- 神経科学
背景:
- ニューロンの可塑性やウイルスの侵入を含む生理学的および病理学的過程において,グリコサミノグリカン (GAG) - タンパク質の相互作用は極めて重要です.
- これらの相互作用のマッピングは,特定のGAG硫化要求およびトランスメブランまたは細胞外マトリックスタンパク質の関与のために困難です.
研究 の 目的:
- 生体細胞におけるGAG結合タンパク質をシステム全体で特定するために,最初のGAGポリサッカリドベースの光相関性プローブを開発し,利用する.
- コンドロイトン硫酸塩 (CS) ベースの光相関性プローブを作成するためのモジュールプラットフォームを確立する.
主な方法:
- コンドロイトン硫酸塩 (CS) ベースの光相性探査機の効率的な組み立てのためのモジュールプラットフォームを開発しました.
- ベンゾフェノンを含有するプローブを使用して,CS-E結合タンパク質をインビトロおよび細胞で選択的に捕獲した.
- GAG結合タンパク質を特定するために,生きたニューロンに探査機を適用した.
主要な成果:
- 開発した探査機を使用して,既知のCS-E結合タンパク質の効率的かつ選択的な捕獲が実証されました.
- 生きたニューロンにおける神経可塑性に関連するCS-E硫化モチーフと相互作用する50以上の新しいタンパク質を特定した.
- アクソン誘導,免疫,シナプス発達の重要な膜受容体を含むいくつかの候補タンパク質を検証した.
結論:
- 開発されたフォトアフィニティ探査機は,GAG-タンパク質の相互作用ネットワークをマッピングするための強力な方法を提供します.
- アルツハイマー病や自閉症などの 神経疾患との関連が明らかになりました
- GAGによる生物学的プロセスと疾患メカニズムの研究を進めた.
さらに関連する動画
関連する概念動画
01:05Proteoglycans
4.5K
Glycans, a class of complex heterogeneous molecules, can be covalently attached to proteins to form glycosylated proteins that regulate various physiological and pathological processes. Glycosylated proteins or glycoproteins comprise N-linked and O-linked oligosaccharides. O-glycosylation is the most common type of protein glycosylation. Here, glycans attach to the oxygen atom of the hydroxyl groups of Serine or Threonine residues. O-linked glycosylation occurs later in protein processing,...
4.5K
03:31Labeling DNA Probes
9.0K
DNA probes are fragments of DNA labeled with a reporter tag to enable their detection or purification. The resulting labeled DNA probes can then hybridize to target nucleic acid sequences through complementary base-pairing, and may be used to recover or identify these regions.
Radioisotopes, fluorophores, or small molecule binding partners like biotin or digoxigenin, are the most widely used reporter tags for labeling DNA probes. These labels can be attached to the probe DNA molecule via...
Radioisotopes, fluorophores, or small molecule binding partners like biotin or digoxigenin, are the most widely used reporter tags for labeling DNA probes. These labels can be attached to the probe DNA molecule via...
9.0K