袋類の胚形成とX不活性化の単細胞トランスクリプトームアトラス

科学分野:

• 発達生物学
• ゲノミクス
• 進化生物学

背景:

• 単細胞RNA配列解析 (scRNA-seq) は,胚の発達に関する高解像度の洞察を提供します.
• 以前の哺乳類のscRNA-seq研究は,エウセリアン種に焦点を当てていた.
• 袋類の研究は 保存された発達因子とX染色体用量補償メカニズムを明らかにすることができます

研究 の 目的:

• 胚形成とX染色体不活性化をscRNA-seqを用いて分析する.
• 保存された系統の特異性とマサピアル-エウテリアの分岐に先立つプラリポテンシー因子を特定する.
• RSXの役割を調査し,インプリントされたX染色体不活性化のレギュレータを特定する.

主な方法:

• オポッサム (Monodelphis domestica) 胚の単細胞RNA配列解析について
• エピブラスト,原始的内皮,およびトロフェクトダームの発達中の転写シグネチャの分析.
• X染色体不活性化パターンとRSX発現の調査

主要な成果:

• 主要な胚系統の発達経路と転写シグネチャーを解明した.
• 哺乳類に共通する 深い保存された系統特有のマーカーを特定した.
• 早期のRSXコーティングとX染色体の不活性化が観察されました.
• X染色体不活性化候補として XSRを特定した.

結論:

• マルシュピアルの胚形成は ユーテリアンと深く保存された特徴を共有しています
• 早期にインプリントされたX染色体の不活性化により,バイアレルXサイレンスが防止される.
• XSRはインプリントされたX染色体不活性化の潜在的な重要なレギュラーであり,X用量補償の進化に関する洞察を提供します.