プラズマプロテオミクスと単細胞トランスクリプトミクスを用いて心筋梗塞後の心不全の候補者を優先する

科学分野:

• 心血管生物学
• プロテオミクス
• ゲノミクス

背景:

• 心不全 (HF) は急性心筋梗塞 (MI) の後の主要な合併症である.
• プラズマのタンパク質と,MI後のHFに関連した遺伝子発現パターンを特定することは,新しいバイオマーカーと治療標的の発見に不可欠です.

研究 の 目的:

• 心筋梗塞後の心不全の発生に関連する血タンパク質とその遺伝子発現を特定する.
• 新種のバイオマーカーと潜在的薬物標的を発見する.

主な方法:

• アプタマーベースのプラズマプロテオミクスは,2つの独立したコホート (CDCSとIMMACULATE) で,MI後の1305のタンパク質を測定するために使用されました.
• 遺伝子共発現ネットワークの加重分析と機械学習を使用して,HFと左心室の放出分子が相関するタンパク質を特定しました.
• タンパク質は,ネズミとヒトのHFモデルから得られた単細胞心臓のトランスクリプトミクスとクロス参照された.

主要な成果:

• CDCSコホートでは,212の異なる発現のプラズマタンパク質が,その後のHFイベントと関連していた.
• メタアナリシスにより,コホート全体で36のプラズマタンパク質と,15の遺伝子タンパク質候補が,トランスクリプトミクスから特定されました.
• 確認された主要なタンパク質には,既知のバイオマーカー (NT-proBNP,トロポニンT) と新しい候補物質 (アニオポエチン-2,トロンボスポンディン-2) が含まれる.

結論:

• 大規模な血プロテオミクスと単細胞心臓トランスクリプトミックは,MI後のHFのタンパク質候補を効果的に優先した.
• この研究では,心筋梗塞後の心不全の管理のための新しいタンパク質バイオマーカーと潜在的な治療目標が特定されました.