人体 の タンパク質 の 量 的 な 地図
Lihua Jiang1, Meng Wang1, Shin Lin2
1Department of Genetics, Stanford University School of Medicine, Stanford, CA 94305, USA.
Cell
|September 11, 2020
まとめ
この研究では 32のヒト組織にわたるタンパク質のレベルを定量化し 組織特有のタンパク質とヒトの生物学と病気への影響を明らかにしました タンパク質とRNAデータを比較することで 遺伝子調節と疾患の表型に関する新しい洞察が得られます
科学分野:
- プロテオミクス
- 人間 組織 生物学
- 遺伝子発現分析
背景:
- ヒトの生物学と病気を理解するには 組織内のタンパク質のレベルに関する知識が必要です
- タンパク質のレベルを制御する規制プロセスは重要ですが,完全に理解されていません.
- タンパク質とRNAのレベルを比較すると 遺伝子の調節に関する洞察が得られます
研究 の 目的:
- 32の正常なヒト組織で12,000以上の遺伝子の相対的なタンパク質レベルを定量化するために.
- 組織特異性または組織強化タンパク質を特定し,トランスクリプトームデータと比較する.
- ヒトの生物学と疾患のフェノタイプを理解する上でタンパク質の組織濃縮の役割を調査する.
主な方法:
- 定量プロテオミクスは32個の正常なヒト組織サンプルで実施された.
- タンパク質レベルは1万2千以上の遺伝子で定量化されました
- タンパク質データを既存のトランスクリプトームデータと比較した.
主要な成果:
- 組織特異性および組織強化タンパク質が32つの組織で特定されました.
- 組織特有のタンパク質をコードする多種多様なトランスクリプトが発見されました.
- RNAとタンパク質の濃縮の不一致は,分泌されるタンパク質の合成と作用の場所を示唆した.
- タンパク質の組織濃縮データは,トランスクリプトデータだけで明らかでない遺伝疾患のフェノタイプを説明した.
結論:
- 人間の組織におけるタンパク質の分布は 複雑な生物学的出来事を詳細に説明します
- タンパク質のレベルを理解することで 遺伝子調節,分泌体,代謝,そして人間の病気に関する 重要な洞察が得られます
- 遺伝子疾患のフェノタイプを全面的に理解するために,タンパク質濃縮データは不可欠です.
さらに関連する動画
10:37Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification
Published on: November 15, 2017
12.5K
05:37Label-Free Quantitative Proteomics Workflow for Discovery-Driven Host-Pathogen Interactions
Published on: October 20, 2020
7.3K
