単細胞 の RNA 配列 解析 は,臓器 特定 の 内皮 細胞 の 独特 な 複写 基 の 特徴 を 明らか に し ます

科学分野:

• 血管生物学
• トランスクリプトミクス
• バイオ情報学

背景:

• 内皮細胞 (ECs) は,異なる組織と血管で機能的な多様性を示す.
• この内皮細胞の異質性の分子基礎は,まだ完全に理解されていません.

研究 の 目的:

• 内皮細胞の特異性のトランスクリプトミックの基礎を調査する.
• 組織特有の内皮細胞のアイデンティティを維持する分子ネットワークを特定する.

主な方法:

• Tabula Murisコンソーシアムの単細胞RNAシーケンシングデータ解析
• 異質性のマーカーとソースを明らかにするために生物情報学のツールの適用.
• 組織特異的なEC間のトランスクリプトミックの関係を分析するためのグラフベースのクラスタリング.

主要な成果:

• 組織特異的なECトランスクリプトームの大量RNA配列解析による検証された単細胞RNA配列解析 (scRNA-seq).
• 組織起源に基づいてECの明確なクラスタリングパターンを特定し,いくつかの重複が観察されました.
• 新しい組織特異のECマーカー,シグナル伝達経路,および性別特異の遺伝子発現 (例えば,男性ECにおけるLars2) が発見されました.
• 人間の胎児組織におけるマウスの心臓と肺のECマーカーの保存が確認された.
• リガンド受容体発現分析により,潜在的血管新生相互作用が発見されました.

結論:

• Tabula Murisからの単細胞RNAシーケンシングデータは,ECのアイデンティティを導く転写ネットワークを効果的に解明しました.
• 組織特異的なECを含む新しい血管新生および機能的関係を特定した.