経路をターゲットとしたクリック化学のアプローチを用いた代謝の深層調査
Jason S Hoki1, Henry H Le1, Karlie E Mellott1
1Boyce Thompson Institute and Department of Chemistry and Chemical Biology, Cornell University, Ithaca, New York 14853, United States.
Journal of the American Chemical Society
|October 14, 2020
まとめ
生物の未知の小さな分子を発見するために 研究者は新しい方法である DIMEN を開発しました この代謝の深遠な調査により,何百もの新しい化合物と 予期せぬ代謝関連が明らかになった.
科学分野:
- メタボロミクスと生化学
- 化学生物学
背景:
- 小分子代謝産物の大多数は 未確認のまま 生物学的過程の理解を妨げています
- 代謝ネットワークの解明は,小分子の生理学的および生態学的機能を理解するために不可欠です.
研究 の 目的:
- 代謝の深層調査のための新しい濃縮戦略を開発する.
- モデル生物のC. elegansで新しい化合物と代謝経路を発見するためにこの戦略を適用します.
主な方法:
- クリック化学に基づく濃縮戦略であるDIMEN (濃縮による代謝の深層調査) の開発.
- 単一のアルキン改変代謝物と固相アジド樹脂をMS/MSベースの識別に使用した.
- DIMENはC. elegansにおけるアスカロシド代謝を研究するために用いられた.
主要な成果:
- DIMENは数百の新しい化合物を発見し,既知の代謝領域を大幅に拡大しました.
- アスカロシド代謝とアミノ酸,炭水化物,エネルギー代謝の間の予期せぬ交差点を発見した.
- 新たに特定された多くの変異は,従来のLC-MS分析では検出できませんでした.
結論:
- DIMENは生物化学ネットワークを深く探査するための強力なツールです. 特に,広範囲の特徴のない構造空間を持つもの.
- この発見は,代謝物質の発見と経路の解明のための化学生物学のアプローチの有用性を強調しています.
- C. elegansの代謝経路の複雑さと相互関係に関する新しい洞察を明らかにしました.
