人間の血清代謝体の潜在的決定因子の参照マップ
Noam Bar1,2, Tal Korem1,2,3,4,5, Omer Weissbrod1,2,6
1Department of Computer Science and Applied Mathematics, Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel.
Nature
|November 12, 2020
まとめ
食生活と腸内微生物群は血清代謝産物のレベルに大きく影響し,機械学習により代謝産物の76%以上を予測する. これらの要因は 遺伝子やライフスタイルと共に 代謝の健康を理解する上で 鍵となるものです
科学分野:
- メタボロミクス
- システム生物学
- 人間 の 健康
背景:
- 血清代謝体は内生性および外生性化合物で構成され,疾患のバイオマーカーとして機能する.
- 遺伝性,腸内微生物群,ライフスタイル,食事などの要因は,いくつかの代謝産物に影響しますが,その主な決定因子はほとんど知られていません.
- メタボライトの起源を理解することは,病気のメカニズムを解読し,介入策を策定する上で極めて重要です.
研究 の 目的:
- 健康なヒトのコホートにおける血清代謝産物濃度の主要な決定因子を特定する.
- ホストの遺伝子,微生物群,臨床,食事,ライフスタイルの要因に基づいてメタボライトレベルを予測するために機械学習を適用する.
- メタボリート濃度に影響を与える特定の食事と微生物の相互作用を明らかにする.
主な方法:
- 491人の健康な個人の血清サンプルから1,251個の代謝物質を分析した.
- 機械学習アルゴリズムは,宿主遺伝学,腸内微生物群データ,臨床パラメータ,食事,ライフスタイル,人類測定を用いて代謝物質のレベルを予測しました.
- 特徴の属性分析とランダム化制御試験を用いて,結果を確認した.
主要な成果:
- 機械学習は,プロファイルされた1,251の代謝物の76%以上について,統計的に有意なレベルを予測することに成功しました.
- ダイエットと腸内微生物群は 最も強い予測因子として現れ,それぞれが数百の代謝産物と 50%以上の多様性を説明しています.
- 微生物群の予測は2つの独立したコホートで検証され,パンの消費と特定の代謝物の増加との間の因果関係が実証されました.
結論:
- ホストの遺伝子,腸内微生物群,食事,ライフスタイルは血清代謝の重要な決定因子です.
- ダイエットと微生物群の相互作用は,メタボリートプロフィールを形成する上で重要な役割を果たし,健康への介入の潜在的なターゲットを提供します.
- この研究は,代謝調節のメカニズム的な理解を提供し,パーソナライズされた代謝健康戦略の道を開きます.
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