NADインタラクタムのプロファイリングのための化学プロテオミクスアプローチ
Justina Šileikytė1, Sunil Sundalam1, Larry L David1
1Department of Chemical Physiology and Biochemistry, Oregon Health and Science University, Portland, Oregon 97239, United States.
Journal of the American Chemical Society
|April 29, 2021
まとめ
研究者らは,ニコチナミドアデニンジヌクレオチド (NAD+) と相互作用するタンパク質を特定するための新しい化学探査機を開発した. これらのツールは新しいNAD+結合タンパク質を発見し,代謝を超えて細胞機能の理解を広げます.
科学分野:
- 生物化学
- 化学生物学
- プロテオミクス
背景:
- ニコチナミドアデニンジヌクレオチド (NAD+) は代謝に不可欠であり,ポリADPリボースポリメラーゼ (PARP) のような酵素の基質として機能する.
- NAD+相互作用の完全な範囲は,その探査のための効果的な化学ツールがないため,おそらく過小評価されている.
研究 の 目的:
- NAD+結合タンパク質をプロファイリングするための新しいクリック可能な光親和性ラベリング (PAL) 探査機の設計,合成,検証.
- これらの化学ツールを使用してNADインタラクタムの新しい成分を特定します.
主な方法:
- クリック可能なPALプローブの開発,特にNAD+に基づいた2-および6-ad-BAD.
- NAD+結合タンパク質を特定するための化学プロテオミクス実験における探査機の応用.
- 2-ad-BAD探査機によるタンパク質の紫外線に依存したラベル付け
主要な成果:
- 2-ad-BAD探査機は効率的で紫外線に依存する PARPのラベル付けを証明した.
- 既知のNAD+/NADH結合タンパク質と新しいNAD結合タンパク質の両方を用いたプロテオミクス研究.
- NADインタラクタームを尋問する探査機の有用性の検証.
結論:
- 開発されたクリック可能なPAL探査機,2-および6-ad-BADは,NADインタラクトームを調査するための効果的なツールです.
- これらの探査機は,新しいNAD+結合タンパク質の発見を容易にし,細胞過程におけるNAD+の役割の理解を進める.
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