免疫媒介疾患における免疫細胞特異遺伝子調節のダイナミックな風景
Mineto Ota1, Yasuo Nagafuchi1, Hiroaki Hatano2
1Department of Allergy and Rheumatology, Graduate School of Medicine, The University of Tokyo, Tokyo 113-0033, Japan; Department of Functional Genomics and Immunological Diseases, Graduate School of Medicine, The University of Tokyo, Tokyo 113-0033, Japan.
この研究では,免疫媒介性疾患の患者からの免疫細胞の遺伝子発現をマッピングしています. 遺伝子の変異が 細胞の種類や疾患状態によって 遺伝子の活動に 異なった影響を及ぼすことを明らかにし 病気のメカニズムへの洞察を提供します
科学分野:
- 免疫学
- 遺伝学
- ゲノミクス
背景:
- 遺伝子研究により,免疫媒介性疾患に関連する多数の局所が特定されています.
- これらの遺伝子変異の機能的影響を理解することは,特に病気の条件下で,病気の病原性を明らかにするために極めて重要です.
研究 の 目的:
- 免疫細胞の遺伝子発現と全ゲノム配列を大規模に分析する.
- 免疫媒介疾患の文脈における免疫細胞における遺伝的変異の機能的影響を調査する.
主な方法:
- 10人の免疫媒介疾患と79人の健康な対照群の337人の患者の28の免疫細胞サブセットから遺伝子発現データを収集した.
- ゲノム全体の配列分析と表現量的な特質ロシ (eQTL) 分析を実施した.
- 分析された細胞型特異的および文脈依存のeQTL効果.
主要な成果:
- 免疫細胞の種類や病気のカテゴリーで 異なった遺伝子発現プロファイルを捉えた.
- 免疫学的条件と細胞タイプによって影響されるeQTL効果の動的変異を特定した.
- 免疫疾患に関連する遺伝的変異において,細胞型特異的および文脈依存のeQTLの有意な濃縮が示された.
結論:
- 特定されたeQTLは,免疫疾患に関連する特定の細胞タイプ,遺伝子,環境要因を伴う.
- この免疫細胞の遺伝子発現アトラスは,病気に関連した変異体の免疫遺伝的機能の理解を高める.
- 免疫媒介性疾患のメカニズムに関する将来の研究に貴重なリソースを提供します.
さらに関連する動画
11:06Genome-wide Analysis of HDAC Inhibitor-mediated Modulation of microRNAs and mRNAs in B Cells Induced to Undergo Class-switch DNA Recombination and Plasma Cell Differentiation
Published on: September 20, 2017
11:50Retroviral Transduction of Helper T Cells as a Genetic Approach to Study Mechanisms Controlling their Differentiation and Function
Published on: November 4, 2016
関連する概念動画
Regulation of Hematopoietic Stem Cells
T Cell Types and Functions
Th1 cells stimulate dendritic cells to express necessary co-stimulatory molecules on their surfaces for...
Inflammatory Response
Inflammation can be triggered by various stimuli, such as impact, abrasion, chemical irritation, infections, and extreme hot or cold temperatures. These can damage cells and connective tissue fibers,...
Epigenetic Regulation
X-chromosome...
Autoimmune Disorders
Concept and Mechanism of Autoimmune Diseases
The immune...
General Transcription Factors
