ヒト肺の内皮細胞の統合単細胞アトラス

Jonas C Schupp¹, Taylor S Adams¹, Carlos Cosme¹

¹Pulmonary, Critical Care and Sleep Medicine (J.C.S., T.S.A., C.C., N.O., M.C., K.-A.R., E.P.M., M.S., G.D., F.A., N.N., X.Y., N.K.), Yale University School of Medicine, New Haven, CT.

Circulation

|May 25, 2021

まとめ

この研究は,ヒトの肺内皮細胞のアトラスを包括的に示し,これまで知られていなかった細胞タイプと種間の保存されたマーカーを明らかにしています. この資料は肺血管の多様性と疾患状態の理解を深めるものです.

科学分野:

肺と血管の生物学
単細胞ゲノム
人間の解剖学と生理学

背景:

人間の肺内皮の細胞の多様性は,まだ完全に理解されていません.
肺内皮細胞 (ECs) の系統的特徴は,その現象的多様性と組成を理解するために必要である.
既存の知識のギャップは,肺血管の構造と機能の詳細な理解を妨げています.

研究の目的:

人間の肺内皮細胞 (ECs) の参照アトラスを作成する.
肺内皮の表型多様性と細胞組成のより深い理解を促進する.
人間の肺内の新しい内皮のサブ集団を特定し,特徴づけること.

主な方法:

6つのヒト肺データセットからの単細胞RNAシーケンシング (scRNAseq) データを再処理した.
繰り返しクラスタリングと微分表現分析を行い,EC集団を特徴づけました.
光顕微鏡検査と in situ ハイブリダイゼーションを用いてマーカー遺伝子を検証し,マウスと肺高血圧データを用いて種間および疾患関連性を分析した.

主要な成果:

73人の1万5千以上の血管系 ECを特定し固有の内皮系を明らかにした
肺静脈 (COL15A1^neg) と全身静脈 (COL15A1^pos) ECを含む,以前に区別できないサブ集団を発見し,エアロサイトが確認されました.
マウスの全6つのEC型の存在を確認し,保存されたマーカー遺伝子を特定し,肺高血圧の内皮の多様性を維持した.

結論:

ヒトの正常な肺におけるECの包括的な参照アトラスを開発した.
ヒトとマウスの両方において,以前に認識されていない内皮の集団が確認され,詳細に記載されています.
このアトラスは肺血管の生物学と疾患の研究に価値ある資源を提供している.

キーワード:

内皮細胞マイクロ循環肺循環トランスクリプトーム

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