MERFISHによるマウスの原発運動皮質の空間的に解明された細胞アトラス
Meng Zhang1,2,3, Stephen W Eichhorn1,2,3, Brian Zingg4,5
1Howard Hughes Medical Institute, Harvard University, Cambridge, MA, USA.
Nature
|October 7, 2021
まとめ
研究者はマウスの脳のプライマリモーター皮質を,マルチプレックスされたエラー・ロバスト・フローレスンス・イン・シトゥ・ハイブリダイゼーション (MERFISH) を使用してマッピングした. これは95種類の細胞と その空間的組織を明らかにし 神経回路の機能の洞察を与えました
科学分野:
- 神経科学
- ゲノミクス
- 空間生物学
背景:
- 哺乳類の脳には 複雑な神経回路に編成された 細胞の種類が多様です
- 単細胞RNA配列は 細胞タイプを特定しますが 空間情報を失います
- 脳の機能に対する 細胞の貢献を理解するには 空間と接続性のデータが必要です
研究 の 目的:
- マウスのプライマリモーター皮質の 分子的に定義され,空間的に解明された細胞アトラスを作成する.
- 神経細胞と非神経細胞の空間的組織と接続性を調査する.
主な方法:
- 単細胞トランスクリプトームイメージングのための多重複合エラーロバスト光 in situハイブリダイゼーション (MERFISH).
- マウスの原発運動皮質と 隣接する領域の 約30万の細胞をプロファイリングしました
- ニューロンのプロジェクションをマッピングするためにMERFISHと逆行ラベルを統合する.
主要な成果:
- 95の異なるニューロンと非ニューロン細胞群を特定した.
- 刺激性および抑制性ニューロンのクラスターにおける レイナル組織を明らかにした.
- 皮質の深さ軸に沿った連続した遺伝子発現のグラディエンスを示した.
- 複合的なプロジェクションネットワークを発見しました 細胞クラスターは複数の領域をターゲットにし 領域は複数のクラスターからインプットを受け取ります
結論:
- MERFISHは,高解像度の空間細胞アトラスを生成するための強力なツールを提供します.
- ネズミのプライマリモーター皮質は 複雑な空間的組織と接続パターンを表しています
- 細胞の種類と 接続の詳細なマッピングは 脳機能の理解に不可欠です
