データの独立性に基づく質量スペクトロメトリによる定量化学プロテオミックプロファイリング
Fan Yang1, Guogeng Jia1, Jiuzhou Guo2
1Synthetic and Functional Biomolecules Center, Beijing National Laboratory for Molecular Sciences, Key Laboratory of Bioorganic Chemistry and Molecular Engineering of Ministry of Education, College of Chemistry and Molecular Engineering, Peking University, Beijing 100871, China.
Journal of the American Chemical Society
|January 5, 2022
まとめ
DIA-ABPPを開発しました 標識のない手法で データの独立性による質量スペクトロメトリと 活動に基づくタンパク質プロファイルの組み合わせです このアプローチにより,化学プロテオミクスの再現可能で正確な,高通量定量化が可能になります.
科学分野:
- 生物化学
- プロテオミクス
- 化学生物学
背景:
- アクティビティベースのタンパク質プロファイリング (ABPP) は,タンパク質の機能を理解し,薬物の標的を特定するために不可欠です.
- 現在のABPP方法は,データに依存した取得と高価な反応剤により,高通量スクリーニングの限界に直面しています.
研究 の 目的:
- 高通量分析のための効率的な,ラベルフリーな定量化学プロテオミック方法を開発する.
- 多次元研究のための既存のABPP技術の限界を克服する.
主な方法:
- 活動ベースのタンパク質プロファイリング (ABPP) を含むデータ独立型 (DIA) マススペクトロメトリ.
- DIA-ABPPという新しい方法を開発しました.
- 機能的なシステインアームをプロファイルするためにDIA-ABPPを適用した.
主要な成果:
- 良い再現性と高精度で定量化できました.
- 高通量量化能力が実証されている.
- 代謝産物に対するシステインの感受性,結合可能なシステインのスクリーニング,および昼間システノームの変動の分析が成功しました.
結論:
- DIA-ABPPは,ラベルのない定量化学プロテオミクスのための効率的で強力なプラットフォームを提供します.
- この方法は,プロテオームと小分子相互作用の詳細なプロファイリングのためのABPPの範囲を拡大します.
- 多次元機能プロテオーム解析の新たな道を開く
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