空間プロテオゲノミクスは,独特で進化的に保存された肝臓マクロファージのニッチを明らかにする

Martin Guilliams¹, Johnny Bonnardel¹, Birthe Haest¹

¹Laboratory of Myeloid Cell Biology in Tissue Homeostasis and Regeneration, VIB-UGent Center for Inflammation Research, Technologiepark-Zwijnaarde 71, Ghent 9052, Belgium; Department of Biomedical Molecular Biology, Faculty of Science, Ghent University, Belgium.

Cell

|January 12, 2022

まとめ

肝臓をマッピングしています

科学分野:

ヘパトロジー
免疫学
システム生物学

背景:

肝臓は体最大の固体器官で詳細な説明が必要です
肝臓細胞の異質性や空間的組織を理解することは,病気の研究にとって極めて重要です.

研究の目的:

健康で肥満なヒトとネズミの肝臓の空間的タンパク質アトラスを作成する
脂質関連マクロファージ (LAM) を含む全ての肝臓細胞タイプを特定し,局所化する.
種間のマクロファージのアイデンティティの保存された細胞ニッチとマイクロ環境のドライバーを調査する.

主な方法:

マルチオームデータセットの統合:単細胞CITE-seq,単核シーケンシング,空間トランスクリプトミクス,および空間プロテオミクス.
肝臓細胞の差別化と局所化のための検証された戦略の開発.
種間の肝臓アトラスの並べ替え

主要な成果:

肝臓の包括的な空間プロテオゲノムアトラスを生成した.
脂質関連マクロファージ (LAMs) が同定され,胆管の近くに位置しました.
保存されたクッファー細胞とLAMプログラムは7種で明らかにされました.
マクロファージのアイデンティティに影響を与える空間的に解明された細胞ニッチとマイクロ環境回路が発見されました.
ステアトーシック領域における局所的脂質露出によるLAM誘導が実証された.
クッファー細胞の発達は,ALK1- BMP9/ 10軸経由で肝臓の星状細胞のクロストークに依存することが示された.

結論:

この研究は,肝臓細胞の特徴化のための高解像度の空間アトラスを提供します.
LAMは肝臓の脂質暴露によって誘発される独特のマクロファージ集団です.
クッファー細胞の発達は,特定の肝臓の微環境相互作用によって調節される.

キーワード:

CITE-seq についてクッファー・セル NAFLD 種間関係アトラス脂質関連マクロファージ肝臓マルチオミックプロテオゲノミクス空間トランスクリプトミクス

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