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研究分野生物医学と臨床科学腫瘍学とがん発生分子標的
転移したヒトがんの抗腫瘍新抗原反応性T細胞の分子シグネチャー

転移したヒトがんの抗腫瘍新抗原反応性T細胞の分子シグネチャー

Frank J Lowery ¹, Sri Krishna ¹, Rami Yossef ¹, Neilesh B Parikh ¹, Praveen D Chatani ¹, Nikolaos Zacharakis ¹, Maria R Parkhurst ¹, Noam Levin ¹, Sivasish Sindiri ¹, Abraham Sachs ¹, Kyle J Hitscherich ¹, Zhiya Yu ¹, Nolan R Vale ¹, Yong-Chen Lu ¹, Zhili Zheng ¹, Li Jia ², Jared J Gartner ¹, Victoria K Hill ¹, Amy R Copeland ¹, Shirley K Nah ¹, Robert V Masi ¹, Billel Gasmi ¹, Scott Kivitz ¹, Biman C Paria ¹, Maria Florentin ¹, Sanghyun P Kim ¹, Ken-Ichi Hanada ¹, Yong F Li ¹, Lien T Ngo ¹, Satyajit Ray ¹, Mackenzie L Shindorf ¹, Shoshana T Levi ¹, Ryan Shepherd ³, Chris Toy ¹, Anup Y Parikh ¹, Todd D Prickett ¹, Michael C Kelly ⁴, Rachel Beyer ¹, Stephanie L Goff ¹, James C Yang ¹, Paul F Robbins ¹, Steven A Rosenberg ¹

Frank J Lowery ¹, Sri Krishna ¹, Rami Yossef ¹

¹Surgery Branch, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892, USA.
²National Institutes of Health Library, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892, USA.
³Vector Production Facility, Clinical Research Directorate, Frederick National Laboratory for Cancer Research, Bethesda, MD 20892, USA.
⁴Single Cell Analysis Facility, Cancer Research Technology Program, Frederick National Laboratory, Bethesda, MD 20892, USA.

⁰Surgery Branch, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892, USA.

Science (New York, N.Y.) +

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2022年2月3日

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まとめ

この要約は機械生成です。

腫瘍特異のT細胞受容体 (TCRs) を特定することは,がん免疫療法において極めて重要です. この研究は,TCR機能を予測できる腫瘍浸透性リンパ球 (TIL) のTCRシグネチャーを明らかにし,細胞ベースのがん治療を進めている.

科学分野

免疫学
腫瘍学
ゲノミクス

背景

抗腫瘍T細胞受容体 (TCRs) の正確な識別は,効果的な細胞ベースのがん免疫療法の開発における重要な障害である.
腫瘍浸透性リンパ球 (TIL) は抗腫瘍免疫において重要な役割を果たしますが,それらの特定のTCRを特定することは困難です.

研究の目的

転移性腫瘍からの新抗原特異性TCRクローン型 (NeoTCRs) を特定し,特徴づけること.
トランスクリプトミックのデータに基づいて,ネオアンチゲン反応性TILの予測シグネチャーを確立する.
癌の免疫療法の設計におけるこれらのシグネチャーの可能性を評価する.

主な方法

10つの転移したヒト腫瘍からの55のNeoTCRの単細胞転写体分析.
TCRのクローン型を対応するTILトランスクリプトームにマッピングし,CD8+とCD4+のネオアンチゲン反応性TILを識別する.
NeoTCRシグネチャーの予測と検証

主要な成果

CD8+とCD4+のネオアンチゲン反応性TILの特異なトランスクリプトミカルシグネチャを特定した.
ネオアンチゲン特異のTILは,腫瘍特異の拡大と機能不全の表型を示した.
NeoTCRシグネチャーは,腫瘍抗原と自律腫瘍を認識するTCRを成功裏に予測しました.
NeoTCRシグネチャーの標的はネオアンチゲンと他の腫瘍アンチゲンで TIL消耗プログラムが共通していることが判明した.

結論

NeoTCRシグネチャーは,転移性腫瘍におけるTILの包括的なマップを提供します.
TILのトランスクリプトミックの状態は,がん免疫療法における正確なTCR予測を可能にします.
このアプローチは,機能的なTCRを特定することによって,細胞ベースの治療法の設計を容易にする.

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