CRISPRの活性化と干渉スクリーンは,原始的なヒトT細胞における刺激反応をデコードする
Ralf Schmidt1,2, Zachary Steinhart1,2, Madeline Layeghi1
1Gladstone-UCSF Institute of Genomic Immunology, San Francisco, CA 94158, USA.
Science (New York, N.Y.)
|February 3, 2022
まとめ
研究者はヒトのT細胞のCRISPRスクリーンを用いて サイトカイン生成を制御する遺伝子を発見しました この発見は 癌や自己免疫性疾患に対する 新しい免疫療法につながるかもしれません
科学分野:
- 免疫学
- 分子生物学
- 遺伝学
背景:
- T細胞におけるサイトカイン生成の調節は,免疫反応にとって極めて重要です.
- T細胞のサイトカイン生成の調節不良は,自己免疫性,免疫不全,および癌に関与しています.
- 主要なヒトT細胞における サイトカイン調節物質の発見は困難です
研究 の 目的:
- 主要なヒトT細胞におけるインタールイキン-2 (IL-2) とインターフェロン-ガンマ (IFN-γ) 産生を制御する遺伝子ネットワークを体系的に特定する.
- 主要なヒトT細胞における全ゲノムCRISPR活性化 (CRISPRa) と干渉 (CRISPRi) のスクリーニング方法を開発し,適用する.
- T細胞の活性化と サイトカインのプロフィールに 遺伝的変異がどのように影響するかを明らかにする
主な方法:
- ゲノム全体のCRISPR活性化 (CRISPRa) とCRISPR干渉 (CRISPRi) のスクリーンは,原始ヒトT細胞で実施されました.
- 配列化されたCRISPRaスクリーンは,ヒット確認と多重化セクレトームの特徴化に使用された.
- 単細胞RNA配列は,特定された遺伝子の深層分子プロファイリングのためのCRISPRスクリーニングと組み合わせられました.
主要な成果:
- CRISPRaとCRISPRiのスクリーンは,IL-2とIFN-γの生成を制御する遺伝子ネットワークを成功裏に特定しました.
- CRISPRaの配列は重要なレギュレータを確認し,変異したサイトカイン分泌プロファイルを示しました.
- T細胞状態とサイトカイン発現を変化させる分子メカニズムを解明した単細胞RNA配列化.
結論:
- 主要なヒトT細胞における全ゲノムCRISPRスクリーンは,サイトカイン調節体の発見に有効です.
- これらの遺伝子はT細胞の機能と サイトカインの生成を再プログラムできます
- この発見は,T細胞の反応を標的とした新しい免疫療法の設計のための洞察を提供します.
