転写因子 タンパク質 インタラクトーム は,心臓病 の 遺伝 的 決定 素 を 明らかに し て い ます

科学分野:

• 遺伝学
• 心臓病科
• プロテオミクス

背景:

• 生まれつきの心臓病 (CHD) は 新生児の1%に及ぶが,遺伝的原因を特定するのは困難である.
• CHDの遺伝的決定因子は,主要な転写因子のタンパク質相互作用ネットワーク内に存在する可能性があります.

研究 の 目的:

• GATA4 と TBX5 のタンパク質相互作用をヒトの心臓前駆体で調査する.
• インタラクトームデータとエクソーム配列を統合し,新型のCHD関連遺伝子を特定する.

主な方法:

• 定義されたGATA4とTBX5のタンパク質インタラクトーム.
• インタラクタトームデータと 9000のプロバンド・ペアレント・トリオのエクソームデータを統合した.
• 候補遺伝子の優先順位を決めるため,残留物,遺伝子,プロバンド特性に基づいてスコア付けされた変種.

主要な成果:

• GATA4とTBX5のインタラクターム内の de novo ミッセンスの変異を特定した.
• エピジェネティックリーダーGLYR1を含む,おそらく心臓病を引き起こす遺伝子を優先する.
• GLYR1ミッセンスの変異体がGATA4との相互作用を妨害し,心臓遺伝子の活性化と機能を損なうことが示されました.

結論:

• 統合的プロテオミックと遺伝的アプローチにより,新型のCHD関連遺伝子が効果的に特定されます.
• GLYR1は心臓発作に関与する新発見の遺伝子で,心臓発作時にGATA4と相互作用する.
• この枠組みは,心臓病の遺伝的変異を優先化し,調査するのに役立ちます.