Live-seqは,単細胞のタイムラル・トランスクリプトミックの記録を可能にします

科学分野:

• 分子生物学
• ゲノミクス
• 細胞生物学

背景:

• 単細胞RNAシーケンシング (scRNA-seq) は,細胞の異質性を理解するために重要である.
• 現在の scRNA-seq 方法は細胞を溶解し,同じ細胞の後の分析を防ぐ.

研究 の 目的:

• 細胞活性を保ち続ける単細胞トランスクリプトームプロファイリング方法を開発する.
• 細胞のトランスクリプトームと 下流の分子および現象的行動の結合を可能にします

主な方法:

• Live-seqはRNA抽出のために流動力顕微鏡を用いて,細胞の生存能力を維持します.
• ベンチマーキングは細胞の成長,機能的反応,およびトランスクリプトームの読み取りを評価することでした.
• 概念実証研究では,マクロファージと脂肪系ストロマ細胞の順次プロファイリング,およびトランスクリプトミア記録が含まれていました.

主要な成果:

• Live-seqは様々な細胞タイプと状態を最小限の細胞混乱で精密に層分けします.
• 刺激/差別化後のマクロファージと脂肪系ストロマ細胞の経路の連続的なマッピングが実証された.
• マクロファージのLPS応答の異質性の重要な決定因子として,基礎Nfkbia発現と細胞サイクル状態を特定した.

結論:

• Live-seqは,scRNA-seqをエンドポイント分析から時間分析アプローチに変換する.
• この方法は,トランスクリプトームのデータを下流の細胞行動と直接結合することを可能にします.
• ダイナミックな細胞のプロセスと反応を研究するための新しい道を開きます.