がんにおける空間的および細胞的異質性に対する腫瘍内微生物群の影響

科学分野:

• 腫瘍学
• 微生物学
• ゲノミクス

背景:

• 腫瘍に関連した微生物群は,腫瘍の微環境の重要な構成要素です.
• 以前の研究では 大量組織分析により 微生物群の空間的分布と局所的な影響が隠されていました

研究 の 目的:

• 先進的な空間プロファイリングと単細胞シーケンシングを使用して,腫瘍内の空間,細胞,および分子宿主-微生物の相互作用を明らかにする.
• 腫瘍内微生物の組織的な分布と機能的影響を理解する.

主な方法:

• 局所微生物コミュニティの識別と局所化のために10xVisium空間トランスクリプトミクスを適応した.
• バクテリアのニッチ特性を分析するために GeoMx デジタル空間プロファイリングを使用しました.
• 単細胞宿主-微生物の相互作用分析のためにINVADEseq (侵入-粘着指向表現シーケンシング) を開発し,適用した.

主要な成果:

• バクテリアのコミュニティは,より低いKi-67レベルを示す悪性細胞に関連した,血管化が少ない,免疫抑制性マイクロニッチで発見されました.
• 細胞関連細菌と相互作用する宿主細胞を特定し,炎症,転移,休眠,DNA修復の経路の変化を明らかにした.
• 細菌に感染した癌細胞が 単独で侵入し 骨髄細胞を集め 腫瘍の進行を促すことが示されました

結論:

• 腫瘍内微生物群の分布は特定のマイクロニッチ内で高度に組織されています.
• これらの微生物群に富んだマイクロニッチは 癌の進行を活発に促進する 免疫細胞と上皮細胞の機能を備えています