マルチプレックス・ベース・エディティングは,真菌の天然製品のゲノムマイニングの組み合わせによる表遺伝子制御を可能にします
Fanglong Zhao1, Chunxiao Sun1, Zhiwen Liu1
1Department of Chemical and Biomolecular Engineering, Rice University, Houston, Texas 77005, United States.
Journal of the American Chemical Society
|December 21, 2022
まとめ
研究者は効率的な真菌ゲノム操作のためのマルチプレックスベース編集 (MBE) プラットフォームを開発しました. このツールは,アスペルギルス・ニドゥランスの神秘的な遺伝子クラスタを活性化することによって,新しい天然製品 (NP) の発見を可能にしました.
科学分野:
- 合成生物学
- 自然産物の発見
- 菌類のゲノミクス
背景:
- 繊維状の真菌における自然産物 (NP) のゲノム採掘は,複雑な遺伝子調節によって妨げられています.
- エピジェネティック改変は真菌の遺伝子転写に影響するが,複数の遺伝子の同時操作は限られている.
研究 の 目的:
- 菌類のゲノム操作を効率的かつ効率的にするための新しいプラットフォームを開発する.
- 新しいNPの発見のための 謎の遺伝子クラスターの活性化.
主な方法:
- 複数の塩基エディティング (MBE) プラットフォームを開発し,最大8つの遺伝子を同時に無効化する.
- MBEの適用は,Aspergillus nidulans*の3つのネガティブな表皮遺伝子レギュレータを組み合わせて無効化する.
- 新しいNPを特定するための活性化遺伝子群の分析.
主要な成果:
- MBEプラットフォームは 菌類のゲノム操作の 高い能力とスループットを実証しました
- エピジェネティック・レギュレータの結合不活性化により 8つの謎の遺伝子群が活性化しました
- 独特のシコリンとポリアミンのハイブリッド化学物質の新型NPの特定
結論:
- スケール可能で効率的な MBE プラットフォームは キノコのゲノム操作を大幅に進めてくれます
- このアプローチは,糸状菌から新しいNPのゲノム採掘を容易にする.
- MBEプラットフォームは 菌類の化学的多様性を 活用するための強力な戦略です
