空間プロテオミクスの3次元原型
Harsharan Singh Bhatia1, Andreas-David Brunner2, Furkan Öztürk3
1Insititute for Tissue Engineering and Regenerative Medicine (iTERM), Helmholtz Zentrum München, 85764 Neuherberg, Germany; Institute for Stroke and Dementia Research, Klinikum der Universität München, Ludwig-Maximilians University Munich, 81377 Munich, Germany.
Cell
|December 23, 2022
まとめ
DISCO-MSは全臓器と生物の3D空間分子プロファイリングのための新しい技術です. アルツハイマー病や脳損傷のような 複雑な疾患の洞察を明らかにします
科学分野:
- バイオテクノロジー
- プロテオミクス
- 神経科学
背景:
- 空間的分子プロファイリングは 健康と病気における細胞の機能を理解するために不可欠です
- 既存の方法では 3D 画像を用いた大きな生物サンプルを 分子分析する能力が不足しています
- 臓器や有機体全体における 分子の空間的分布を 分析できる技術が必要です
研究 の 目的:
- 臓器と生物の3D空間的分子プロファイルの新技術であるDISCO-MSを導入する.
- DISCO-MSがクリアされた組織とクリアされていない組織から高品質のプロテオミクデータを生成する能力を実証する.
- DISCO-MSを神経科学と心血管疾患の複雑な生物学的問題を調査するために適用する.
主な方法:
- DISCO-MSは組織クリア,3Dイメージング,ディープラーニング分析,ロボット抽出,超高感度質量スペクトロメトリを統合しています.
- DISCO-botシステムは プロテオミクス分析のための組織サンプルを自動化します.
- DISCO- MSから得られたプロテオミクスのデータは,歯類とヒトの組織を用いた伝統的な方法と比較した.
主要な成果:
- DISCO-MSは,未処理のサンプルから得られたデータと同等のプロテオームデータを成功裏に生成した.
- この技術は脳損傷モデルにおけるマイクログリアの活性化をマッピングするために使用されました.
- DISCO-MSは,アルツハイマー病のモデルにおけるアミロイドβプラークを特徴づけ,無傷のマウス体と人間の大動脈プラークにおける免疫細胞の異質性を分析した.
結論:
- DISCO-MSは,3Dイメージング後の臨床前と臨床のサンプル全体の偏見のないプロテオーム分析を提供します.
- この技術は複雑な疾患の診断マーカーと 治療標的を特定するための 新たな道を開きます
- DISCO-MSは空間レベルで組織の異質性や疾患メカニズムを より深く理解することを容易にする.
関連する概念動画
Electron Microscope Tomography and Single-particle Reconstruction
2.5K
Transmission electron microscopy (TEM) can be used to determine the 3D structure of biological samples with the help of techniques such as electron microscope tomography and single-particle reconstruction. While single-particle reconstruction can examine macromolecules and macromolecular complexes in vitro conditions only, tomography permits the study of cell components or small cells in vivo.
Electron Tomography
Electron tomography can be performed either in TEM or STEM (scanning transmission...
Electron Tomography
Electron tomography can be performed either in TEM or STEM (scanning transmission...
2.5K
Proteomics
7.7K
A proteome is the entire set of proteins that a cell type produces. We can study proteomes using the knowledge of genomes because genes code for mRNAs, and the mRNAs encode proteins. Although mRNA analysis is a step in the right direction, not all mRNAs are translated into proteins.
Proteomics is the study of proteomes' function. It involves the large-scale systematic study of the proteome to denote the protein complement expressed by a genome. Scientist Mark Wilkins coined the term...
Proteomics is the study of proteomes' function. It involves the large-scale systematic study of the proteome to denote the protein complement expressed by a genome. Scientist Mark Wilkins coined the term...
7.7K


