Jove
Visualize
お問い合わせ

関連する実験動画

マイクロコンピュータのシーケンス分析

G C Cannon1

  • 1Roche Institute of Molecular Biology, Roche Research Center, Nutley, NJ 07110.

Science (New York, N.Y.)
|October 2, 1987
PubMed
まとめ
この要約は機械生成です。

DNASTARは,ホモロジーとデータベースの検索などの柔軟なシーケンス分析タスクのためのより多くのオプションを提供しています. MicroGenieとIBI-Pustellは,より集中的な必要性のない研究室にとって,満足のいく,費用対効果の高い代替案を提供します.

関連する実験動画

関連する概念動画

こちらも読む

関連記事

共著者、ジャーナル、引用グラフによってこの研究に関連する記事。

並び替え
Same author

Organellar DNA synthesis in permeabilized soybean cells.

Plant molecular biology·2013
Same author

Microcompartments in prokaryotes: carboxysomes and related polyhedra.

Applied and environmental microbiology·2001
Same author

Sc3p hydrophobin organization in aqueous media and assembly onto surfaces as mediated by the associated polysaccharide schizophyllan.

Biomacromolecules·2001
Same author

Carbon cycling: the prokaryotic contribution.

Current opinion in microbiology·2001
Same author

Spectroscopic evidence for amyloid-like interfacial self-assembly of hydrophobin Sc3.

Biochemical and biophysical research communications·2001
Same author

The 68 kDa DNA compacting nucleoid protein from soybean chloroplasts inhibits DNA synthesis in vitro.

Plant molecular biology·1999
Same journal

Erratum for the Research Article "Detecting supramolecular organic nanoparticles during heat wave".

Science (New York, N.Y.)·2026
Same journal

Local signals, systemic decline.

Science (New York, N.Y.)·2026
Same journal

The mechanics of liver regeneration.

Science (New York, N.Y.)·2026
Same journal

Computing in a memory with physics.

Science (New York, N.Y.)·2026
Same journal

Retraction.

Science (New York, N.Y.)·2026
Same journal

Making time.

Science (New York, N.Y.)·2026
関連記事をすべて見る
JoVE
x logofacebook logolinkedin logoyoutube logo
JoVEについて
概要リーダーシップブログJoVEヘルプセンター
著者向け
出版プロセス編集委員会範囲と方針査読よくある質問投稿
図書館員向け
推薦の声購読アクセスリソース図書館諮問委員会よくある質問
研究
JoVE JournalMethods CollectionsJoVE Encyclopedia of Experimentsアーカイブ
教育
JoVE CoreJoVE BusinessJoVE Science EducationJoVE Lab Manual教員リソースセンター教員サイト
利用規約
プライバシーポリシー
ポリシー

科学分野:

  • バイオインフォマティックス
  • コンピュータ生物学 コンピュータ生物学
  • 分子生物学ソフトウェア

背景:

  • 配列分析ソフトウェアは,分子生物学の研究において極めて重要です.
  • 異なるソフトウェアパッケージの評価は,研究室のワークフローを最適化するために不可欠です.
  • 費用とユーザーフレンドリー性は,普及の重要な要因です.

研究 の 目的:

  • DNASTAR,MicroGenie,およびIBI-Pustellの3つのDNA配列分析ソフトウェアパッケージの性能と機能を比較する.
  • 各パッケージの強みと弱みを特定し,さまざまなタイプの分析を行う.
  • 特定のニーズとリソースに基づいて,研究室に対して勧告を提供すること.

主な方法:

  • DNA配列分析ソフトウェアの比較分析.
  • 制限サイト検索,ホモロジー決定,類似性決定,データベース検索などのタスクにおけるソフトウェアのパフォーマンスの評価.
  • ユーザーインターフェイス,機能,ドキュメントの評価.

主要な成果:

  • 明確に定義されたタスクでは,パッケージ間の違いは最小限でした.
  • DNASTARは,ホモロジー,類似性,データベースの検索に優れた柔軟性とオプションを提供しました.
  • マイクロGenieとIBI-Pustellは,より少ない要求の配列分析のための実行可能で費用対効果の高い代替案です.
  • MicroGenieは,ユーザーフレンドリーなインターフェイスとマルチユーザーサポートを備えています.
  • IBI-Pustellは,正確かつ迅速な分析を提供していますが,直感的なユーザーインターフェースはあまりありません.

結論:

  • DNASTARは,柔軟性を要求する包括的な配列分析に推奨されます.
  • MicroGenieとIBI-Pustellは,予算が限られている,または頻度の低い分析を必要とする研究室に適しています.
  • シーケンス分析ソフトウェアを選択する際には,ユーザーインターフェースと特定の機能が考慮されるべきです.