誘導的微分化の転写因子アトラス
Julia Joung1, Sai Ma2, Tristan Tay3
1Department of Biological Engineering, MIT, Cambridge, MA 02139, USA; Department of Brain and Cognitive Science, MIT, Cambridge, MA 02139, USA; Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA 02142, USA; McGovern Institute for Brain Research at MIT, Cambridge, MA 02139, USA; Howard Hughes Medical Institute, MIT, Cambridge, MA 02139, USA.
研究者は,大規模なTFライブラリと単細胞発現プロフィールを用いてヒトの転写因子 (TF) 機能をマッピングした. このTFアトラスは,細胞工学のための正確な細胞型生成と疾患モデリングを可能にします.
科学分野:
- 分子生物学
- ゲノミクス
- 幹細胞生物学
背景:
- 転写因子 (TF) は,細胞のプロセスと状態を制御する遺伝子発現の重要な調節因子である.
- TFの完全な機能能力を理解することは,セル状態制御とエンジニアリングに不可欠です.
研究 の 目的:
- 全面的なリソースであるTFアトラスを作成し,すべてのヒトTFスプレイスアイソフォームによって誘発される表現プロファイルを図表します.
- 精密な細胞型生成,疾患モデリングを可能にし,細胞工学の努力を加速します.
主な方法:
- ヒトのTFスプライスアイソフォームの3,500以上のバーコードライブラリを開発しました.
- 単細胞発現プロフィール (TF アトラス) のためのヒト胚性幹細胞 (hESC) にライブラリを適用した.
- 統合されたmRNA発現とクロマチンのアクセシビリティデータ; TF組み合わせの予測モデルを開発した.
主要な成果:
- TF誘発表現プロファイルを基準細胞タイプにマッピングした.
- 3つの生殖層とトロフォブラスト全体で多様な細胞タイプを生成するための検証されたTF.
- 細胞疾患モデルを作成し 下流の遺伝子調節体を特定しました
結論:
- TFアトラスは,TFの機能を理解し,細胞の運命を導くための強力なプラットフォームを提供します.
- このリソースは特定の細胞の設計と 疾患モデルの開発を加速します
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