ナノモラー・アフィニティのDNAアプタマーに対するAdenosineとATP SELEXのプッシング
1Department of Chemistry, Waterloo Institute for Nanotechnology, University of Waterloo, Waterloo, Ontario N2L 3G1, Canada.
Journal of the American Chemical Society
|March 22, 2023
まとめ
アデノシンとアデノシントリフォスファート (ATP) を標的とする新しいDNAアプタマーは,著しく高い親和性を示す. これらの新しいアプタマーは,バイオセンシングとDNAナノテクノロジーのアプリケーションの性能を改善します.
科学分野:
- 生物化学
- 分子生物学
- バイオテクノロジー
背景:
- アデノシンとアデノシントリフォスファート (ATP) の古典的なDNAアプタマーは,バイオセンシング,イメージング,DNAナノテクノロジーで広く使用されています.
- 以前のアプタマー選択では,高いATP濃度が用いられ,アプタマー選択と親和性に潜在的に影響を与えた.
研究 の 目的:
- アデノシンとATPの親和性を高める新しいDNAアプタマーを開発する.
- 低マイクロモラー標的濃度下でのアプタマー選択のダイナミクスを調査する.
- アプタマー構造と変異分布に関する長年の疑問を解決する.
主な方法:
- 低マイクロモラー濃度でアデノシンとATPをターゲットとして2つの別々のアプタマー選択を行った.
- 選択中にライブラリ構成と変異分布を分析するために深層配列化を使用した.
- 新しいアプタマーの二次構造と特定の結合を確認するための変異研究を実施した.
- アプタマーの選択性を評価するための糸移動バイオセンサを開発した.
主要な成果:
- 解離定数 (Kd) が230nMの2つの新しいDNAアプタマーを特定し,古典アプタマーよりも約30倍高い親和性を示した.
- 後の選択ラウンドで古典的なアプタマー配列の抑制が観察され,より高い親和性の結合物質の出現を示しています.
- 新しいアプタマーが 単一の標的分子に結合することを確認しました 伝統的なアプタマーとは違います
- 鎖移転バイオセンサを使用してアデノシンとその核酸に対する選択性が実証された.
結論:
- アデノシンとATPに対する afinityが著しく改善された新しいDNAアプタマーが開発されました.
- アプタマー選択における低マイクロモラー標的濃度は,高親和性アプタマーを生成する.
- 発見は,アテマー選択機構とアデノシン/ATPアテマー特性を洞察する.
- 新しく開発されたアプタマーは バイオセンシングの応用が期待されています
