タスマニア 悪魔 の 2 種 の 伝染 性 がん の 進化
Maximilian R Stammnitz1, Kevin Gori1, Young Mi Kwon1
1Transmissible Cancer Group, Department of Veterinary Medicine, University of Cambridge, Cambridge, UK.
タスマニアの悪魔には DFT1とDFT2という 2種類の感染症があります 遺伝分析により 進化の異なる経路と 変異率が明らかになり これらの独特の癌の系統の並行進化が 明らかになりました
科学分野:
- ゲノミクス
- 進化生物学
- 癌 研究
背景:
- タスマニアの悪魔は,悪魔の顔腫瘍1 (DFT1) と悪魔の顔腫瘍2 (DFT2) の2つの伝染性がんにより絶滅の危機に瀕しています.
- これらの伝染性の癌の 遺伝的多様性と進化を理解することは 保存の取り組みにとって 極めて重要です
研究 の 目的:
- DFT1とDFT2の遺伝的多様性と進化の軌道を調査する.
- 変異率を比較し,これらの伝染性がんに作用する選択圧力を特定する.
主な方法:
- 新しい染色体レベルの基準を用いた78のDFT1と41のDFT2ゲノムの分析.
- 発現時期を推定するための時間解析の系統遺伝分析
- 集団の異質性と変異率を評価するためのサブクローン分析.
主要な成果:
- DFT1は1986年 (1982年 - 1989年) に登場し,DFT2は2011年 (2009年 - 2012年) に登場した.
- DFT2はすべての変異クラスでDFT1よりも高い変異率を示しています.
- 超変異したDFT1系統と欠陥のあるDNAミスマッチ修復が特定されました.
- Y染色体喪失とMGA不活性化を含む特定の場所での陽性選択の証拠は見つかったが,これらは両方の癌に共通していなかった.
結論:
- DFT1とDFT2は 異なる起源と遺伝的特徴にもかかわらず 長期にわたる平行進化を示しています
- 発見は,単一の宿主集団内の伝染性がんの進化動態に関する洞察を提供します.
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