ゲノム全体の遺伝的混乱のプロテオミクスの風景

科学分野:

• プロテオミクス
• システム生物学
• 機能的ゲノミクス

背景:

• 機能的ゲノム戦略は,遺伝子機能と規制ネットワークを理解するために不可欠です.
• 定量プロテオミクスは ゲノムデータを補完する強力なアプローチを提供します

研究 の 目的:

• 機能的ゲノミクスとプロテオミクスを組み合わせて,タンパク質の豊富さを量化する.
• Saccharomyces cerevisiaeの タンパク質発現を制御する原理を明らかにする.
• 機能的なアノテーションのためのゲノムを網羅するリソースを提供する.

主な方法:

• Saccharomyces cerevisiaeのゲノムスケールノックアウトライブラリを利用した.
• タンパク質の豊富さを定量化するためにデータ独立の採取質量スペクトロメトリーを使用した.
• プロテオミクスのプロファイルを持つ統合された機能的ゲノミクスデータ

主要な成果:

• グローバルなタンパク質発現は,一般的な生物学的特性 (例えば,翻訳率,ターンオーバー,複合体の形成,成長率,ゲノム構造) によって影響を受けます.
• ネットワーク接続性 (遺伝的,代謝的,物理的相互作用) などの機能的性質もタンパク質発現を誘導する.
• 機能プロテオミクスは,プロテオームプロフィール類似性,タンパク質共変性,および逆プロテオームプロフィールを介して遺伝子アノテーションを効果的に補完します.

結論:

• ゲノム全体でタンパク質発現を制御する重要な原則を確立した.
• 機能プロテオミクスの有用性を示し,遺伝子の機能アノテーションを強化した.
• イーストのタンパク質と 規制ネットワークを研究する研究者のための貴重なリソースを生み出しました