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大人の乳房の空間的に解明された単細胞ゲノムアトラス

Tapsi Kumar ^1,2, Kevin Nee ³, Runmin Wei ¹

¹Department of Systems Biology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA.
²Graduate School of Biomedical Sciences, University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA.
³Department of Biological Chemistry, University of California, Irvine, Irvine, CA, USA.
⁴Department of Physiology and Biophysics, University of California, Irvine, Irvine, CA, USA.
⁵Math, Computational & Systems Biology, University of California, Irvine, Irvine, CA, USA.
⁶Department of Bioinformatics and Computational Biology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA.
⁷Resolve Biosciences, Monheim am Rhein, Germany.
⁸Akoya Biosciences, Menlo Park, CA, USA.
⁹Department of Pathology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA.
¹⁰Department of Breast Surgical Oncology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA.
¹¹Department of Pathology and Immunology, Baylor Medical College, Houston, TX, USA.
¹²Chao Comprehensive Cancer Center, University of California, Irvine, Irvine, CA, USA.
¹³Department of Surgery, University of Chicago Medicine, Chicago, IL, USA.
¹⁴Department of Surgery, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA.
¹⁵Department of Medicine, Section of Hematology and Oncology, Baylor College of Medicine, Houston, TX, USA.
¹⁶Department of Physiology and Biophysics, University of California, Irvine, Irvine, CA, USA. dalawson@uci.edu.
¹⁷Department of Biological Chemistry, University of California, Irvine, Irvine, CA, USA. kai.kessenbrock@uci.edu.
¹⁸Department of Systems Biology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA. nnavin@mdanderson.org.
¹⁹Graduate School of Biomedical Sciences, University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA. nnavin@mdanderson.org.
²⁰Department of Bioinformatics and Computational Biology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA. nnavin@mdanderson.org.

⁰Department of Systems Biology, UT MD Anderson Cancer Center, Houston, TX, USA.

Nature +

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2023年6月28日

PubMedで要約を見る

まとめ

ヒューマン・ブレスト・セル・アトラス (HBCA) は,単細胞解像度で正常な乳房組織をマッピングし,多様な細胞タイプと空間的組織を明らかにします. この包括的なリソースは,乳腺の生物学と乳がんの理解を助けます.

科学分野

細胞生物学
ゲノミクス
人間の解剖学

背景

以前の研究は乳房の上皮細胞に焦点を当て,上皮細胞以外の細胞タイプはあまり研究されなかった.
乳腺の生物学と疾患を理解するには,正常なヒトの乳腺組織に関する包括的なアトラスが必要です.

研究の目的

ヒト乳房細胞アトラス (HBCA) を単細胞と空間解像度で作成する.
成人の正常な乳腺組織内の細胞タイプと状態を特定し,特徴づけること.

主な方法

126人の女性から 71万4千以上の細胞と 11万7千の核のプロファイリング
4つの異なる技術を用いた空間マッピング
細胞の種類,状態,空間分布を特定するためのバイオ情報分析.

主要な成果

12の主要な細胞タイプと58の異なる生物学的細胞状態の識別
周周細胞,内皮細胞,免疫細胞の大量発見
組織に宿る免疫細胞の豊かな生態系と管状と葉状の領域の明確な分子差異の発見

結論

HBCAはヒトの正常な乳腺組織を前例のない参照マップで示しています
このアトラスは乳腺の発達,生理学,乳がんなどの病気の研究を容易にする.
乳房における非上皮細胞集団とその空間的組織の複雑さを強調する.