μMap フォト近接ラベルは,小分子結合部位のマッピングを可能にします.
Sean W Huth1,2, James V Oakley1,2, Ciaran P Seath1,2
1Merck Center for Catalysis at Princeton University, Princeton, New Jersey 08544, United States.
Journal of the American Chemical Society
|July 20, 2023
まとめ
タンパク質の結合部位をマッピングするために 新しい光触媒方法であるμMapを開発しました このアプローチは,リガンド結合ポケット付近のアミノ酸を特定し,薬剤発見とインビトロおよび生細胞におけるターゲットエンゲージメント分析のための強力なツールを提供します.
科学分野:
- 化学生物学
- 薬物の発見
- プロテオミクス
背景:
- リガンド結合部位の特徴化は,薬剤発見において,特に標的が当初不明であるフェノタイプスクリーニングにおいて不可欠である.
- 既存のX線結晶学や光親近性標識 (PAL) のような方法は,技術的な課題,信号の不足,複雑なデータ分析などの限界があります.
研究 の 目的:
- プロテイン結合部位をマッピングするための堅牢で一般的な光触媒的アプローチを確立し,リガンド結合ポケットに近接する残留物を特定します.
- 既存の構造データのないものを含め,様々な標的タンパク質と薬剤候補を分析するためのこの方法の有用性を実証する.
主な方法:
- タンパク質結合部位のマッピングのための触媒的光触媒方法 (μMap) の開発
- リガンド結合部位の近くにあるアミノ酸を標識するために,触媒活性化を使用する.
- 6つのタンパク質標的と生細胞にインビトロの方法の適用.
主要な成果:
- キナーゼと分子接着剤を含む6種類のタンパク質の結合部位を成功裏にマッピングした.
- STAT3阻害体MM-206の結合部位を調査した.
- 活体細胞内の薬物結合部位のマッピングが成功していることが実証されました.
結論:
- μMapは,リガンド結合ポケットの近くのアミノ酸を識別するための強力で一般化可能な方法を提供します.
- このテクニックは,アミノ酸とペプチドレベルの有価なターゲットエンゲージメントデータを生成します.
- μMapは,結合部位を in vitro と生細胞で特徴づけることができ,薬剤発見の取り組みを進めています.


